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jiaxin531

[交流] Genbank的编号及blast 已有3人参与

1.在Genbank上查询Cyprinid herpesvirus 3也就是koi Herpesvirus,有四个全序列,分别是NC009127、AP008984、DQ177246、DQ657918,想请问:前面的2个英文字母是随机没含义的?还是有什么规则?为什么同种病毒会不同?
2.Human herpesvirus 序列长度单位是nt,为什么是双链DNA,但1-8型的疱疹病毒却用nt这个单位?
3.koi Herpesvirus全长295146bp,用blast与Human herpesvirus 对比,结果是没有相似性,请问bp和nt,会对结果又影响吗?
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antibody01

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):恭喜抢沙发,给个红包
我也想知道。
生活就像强奸,无法反抗就要学会享受; 工作就像轮奸,你不行就要别人上; 社会就像自慰,一切都要靠自己的双手解决。
2楼2009-10-29 15:29:10
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humants

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
与楼上的想法一致。困惑。。。。
3楼2009-10-29 16:29:38
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陈思容

铜虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
NC的话我知道是基因组的前缀,其他几个编号就不知道了
4楼2009-10-29 16:35:57
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生命核心

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ncbi前字母好像是按顺序来的,同样类型的基因因为时间不同,导致前面的字母也不同
5楼2009-10-29 18:43:15
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

我也期望高手指点
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
6楼2009-11-11 13:35:57
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
并且希望有高手可以帮忙上传BLAST软件
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
7楼2009-11-11 13:36:17
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落明逐暗

金虫 (正式写手)

好吃嘴班班长


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一样很疑惑。。。顺便问一句,nt是哪个的简写?
天涯静处无征战,兵气销为日月光。
8楼2009-11-11 15:55:26
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

拭目以待,请高手出招
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
9楼2009-11-11 16:20:00
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zxx0914

金虫 (小有名气)

觉得是随机编号,不可能吧,一个东西怎么会没有相似性呢?纳闷,不懂
10楼2009-11-12 10:28:32
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