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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » Genbank的编号及blast
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jiaxin531

[交流] Genbank的编号及blast 已有3人参与

1.在Genbank上查询Cyprinid herpesvirus 3也就是koi Herpesvirus，有四个全序列，分别是NC009127、AP008984、DQ177246、DQ657918，想请问：前面的2个英文字母是随机没含义的？还是有什么规则？为什么同种病毒会不同？
2.Human herpesvirus 序列长度单位是nt,为什么是双链DNA，但1-8型的疱疹病毒却用nt这个单位？
3.koi Herpesvirus全长295146bp，用blast与Human herpesvirus 对比，结果是没有相似性，请问bp和nt,会对结果又影响吗？
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1楼 2009-10-29 09:11:05
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
并且希望有高手可以帮忙上传BLAST软件
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将有能量帮助他人作为自己的人生追求！
7楼2009-11-11 13:36:17
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humants

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
与楼上的想法一致。困惑。。。。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-10-29 16:29:38
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陈思容

铜虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
NC的话我知道是基因组的前缀，其他几个编号就不知道了
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4楼2009-10-29 16:35:57
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生命核心

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ncbi前字母好像是按顺序来的，同样类型的基因因为时间不同，导致前面的字母也不同
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5楼2009-10-29 18:43:15
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