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jiaxin531

[交流] Genbank的编号及blast已有3人参与

1.在Genbank上查询Cyprinid herpesvirus 3也就是koi Herpesvirus,有四个全序列,分别是NC009127、AP008984、DQ177246、DQ657918,想请问:前面的2个英文字母是随机没含义的?还是有什么规则?为什么同种病毒会不同?
2.Human herpesvirus 序列长度单位是nt,为什么是双链DNA,但1-8型的疱疹病毒却用nt这个单位?
3.koi Herpesvirus全长295146bp,用blast与Human herpesvirus 对比,结果是没有相似性,请问bp和nt,会对结果又影响吗?
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zcqcau

铁杆木虫 (著名写手)

我也期望高手指点
将有能量帮助他人作为自己的人生追求!
6楼2009-11-11 13:35:57
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humants

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
与楼上的想法一致。困惑。。。。
3楼2009-10-29 16:29:38
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陈思容

铜虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
NC的话我知道是基因组的前缀,其他几个编号就不知道了
4楼2009-10-29 16:35:57
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生命核心

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ncbi前字母好像是按顺序来的,同样类型的基因因为时间不同,导致前面的字母也不同
5楼2009-10-29 18:43:15
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