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songbin664

金虫 (正式写手)

民工

[交流] 【求助】问个关于ms模拟界面的问题已有1人参与

在模拟界面时,将两种晶体cleave surface→表面进行优化→build layers→对整个layer minimize→dynamics。计算后发现界面两侧的其中一种原子在界面处发生了位移,另一中原子在远离界面处的另一表面发生位移。
这可能是由于在进行界面优化时constrain搞错了。请高手指教,在build layers我应该怎样才能将未constrain的表面贴在一起。附件中有图示。
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六198

金虫 (正式写手)


songbin664(金币+1,VIP+0):感谢! 8-11 19:26

没见过
穷理求真真贯纵横皆入咏致知格物物含妙理总堪寻
2楼2009-08-10 21:25:22
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pohck

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
songbin664(金币+1,VIP+0): 8-11 15:24
songbin664(金币+1,VIP+0):感谢! 8-11 19:25
songbin664(金币+7,VIP+0): 9-28 21:50
之前是否没有optimize cell? 可能会出现这样的问题。

[ Last edited by pohck on 2009-8-10 at 21:51 ]
3楼2009-08-10 21:48:22
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songbin664

金虫 (正式写手)

民工


zxzj05(金币+1,VIP+0):3Q! 讨论奖励!^_^ 8-11 16:15
我按照创腾地讲义来的,
还有很多地方不懂,高手能不能指点一下啊。
我认为这个问题主要是cleave的两个面没有对在一起。是一个切下的面对上了另一个且下面的背面。不知道怎么调试啊?
4楼2009-08-11 15:27:21
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zxzj05

荣誉版主 (著名写手)

★ ★
songbin664(金币+1,VIP+0):感谢! 8-11 19:25
songbin664(金币+1,VIP+0):感谢! 8-11 19:25
确定是否全部被束缚
储氢家族欢迎储氢研究者!
5楼2009-08-11 16:17:02
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songbin664

金虫 (正式写手)

民工

★ ★
zxzj05(金币+2,VIP+0):鼓励讨论! 10-6 10:11
我感觉应该将两测得原子束缚,使界面处的原子具有活动的余地。因为实验表明界面两侧的原子是可以移动的。
不过非常感谢版主的回答。
我有
1优化表面时是否只优化cleave的面,还是六个面均有优化,或其中几个面?
2我图中所示的界面两侧的surface其中一个并不是cleave出来的,是相对的面?
3如果上面两条所说的是模拟真实的结果的话,这样的界面可行么?
4discover-dynamics后得到的结果有一项是“Pressure (GPa) ”,这项是不是界面处的应力?
非常感谢大家能给我提出建议!
6楼2009-08-11 19:24:49
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pohck

木虫 (小有名气)

★ ★
yjr(金币+1,VIP+0):谢谢!! 8-12 11:30
songbin664(金币+1,VIP+0): 8-12 14:54
觉得应该只优化cleave的面。 其他方向应该认为是bulk的。
除了相对的两个面的一至三层的原子之外,其他的原子都可以束缚。
7楼2009-08-12 10:35:51
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songbin664

金虫 (正式写手)

民工

怎样将优化好的面对在一起呢?现在好像两个面的方向是一样的。所以优化好的面没有对在一起啊。
引用回帖:
Originally posted by pohck at 2009-8-12 10:35:
觉得应该只优化cleave的面。 其他方向应该认为是bulk的。
除了相对的两个面的一至三层的原子之外,其他的原子都可以束缚。

8楼2009-08-12 12:31:30
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pohck

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
qasd(金币+1,VIP+0):xiexie~ 8-12 14:50
songbin664(金币+3,VIP+0): 8-12 14:52
songbin664(金币+1,VIP+0): 8-12 14:54
先要把其中一个面反过来。用movement---rotation 把整个cell 反过来再copy
9楼2009-08-12 13:36:12
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songbin664

金虫 (正式写手)

民工

小弟刚接触这方面,实在是找不到你说的movement在哪啊?能否说的详细一点啊。
引用回帖:
Originally posted by songbin664 at 2009-8-12 12:31:
怎样将优化好的面对在一起呢?现在好像两个面的方向是一样的。所以优化好的面没有对在一起啊。

10楼2009-08-12 14:53:55
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