| 查看: 2079 | 回复: 8 | |||
yangyue5678铜虫 (小有名气)
|
[求助]
分子结构优化之前如何扫描已有2人参与
|
|
求助各位大神，我做了个分子结构优化，有条审稿意见是 The studied molecule can present several minina, a scan on the dihedral angle 4-3-10-15 is necessary before proceeding to the other calculations. 请问这个scan要怎么做呢？谢谢大家 |
回复此楼» 猜你喜欢
QE计算声子ph.out的Γ点出现虚频（-30cm-1）vasp计算没有
已经有0人回复
-
40-50万/年，中国散裂中子源诚聘计算模拟方向博士后
已经有81人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有283人回复
-
香港理工大学计算材料与物理课题组招聘博后
已经有15人回复
-
香港理工大学计算材料与物理课题组招聘博后
已经有15人回复
-
2026博士申请—化学能源方向，本人熟练分子动力学模拟的使用
已经有4人回复
-
西班牙Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia, CSIC-BIST招收公派博士生
已经有0人回复
-
书籍求助：汽车市场营销理论与实务（电子版）——章小平
已经有0人回复
-
英国利物浦大学屠昕和雍雪课题组招收CSC博士生
已经有26人回复
-
北京交通大学王熙教授团队招收2026年入学催化方向博士研究生（还有1个名额）
已经有0人回复
-
华北电力大学（北京）（第一性原理计算）博士招生——学博，专博各1人
已经有40人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
天天进步啊
木虫 (著名写手)
- 应助: 87 (初中生)
- 金币: 6058.7
- 散金: 101
- 红花: 42
- 沙发: 9
- 帖子: 1793
- 在线: 1005.5小时
- 虫号: 3689648
- 注册: 2015-02-15
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2020-07-21 20:53:55
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 586 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26316.1
- 红花: 348
- 帖子: 2021
- 在线: 1440.5小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yangyue5678: 金币+35, ★★★很有帮助 2020-07-21 22:43:11
感谢参与，应助指数 +1
yangyue5678: 金币+35, ★★★很有帮助 2020-07-21 22:43:11
|
具体方法可以看我这个教程的1.10.3节 https://muchong.com/t-14242735-1，具体如截图。 同时这个帖子的附件6就是一个如何用GaussView设置柔性扫描的动图。  QQ截图20200721091154.png |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
yangyue56783楼2020-07-21 21:16:31
yangyue5678
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3.4
- 散金: 286
- 帖子: 94
- 在线: 451.7小时
- 虫号: 1990611
- 注册: 2012-09-10
- 专业: 中药质量评价
4楼2020-07-21 22:42:59
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 586 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26316.1
- 红花: 348
- 帖子: 2021
- 在线: 1440.5小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
| 所谓扫描的意思是 高斯按照你设置的变量 每隔一个角度或者长度算一次能量然后把它们画成一张图。你可以看到能量随着你扫描的变量变化的曲线 这个曲线出现的低点就是可能存在的稳定结构 。你把所有可能的稳定结构都做一次结构优化 算出来能量 比较一下谁高谁低 或者用boltzman distribution算算看每一个稳定结构的占比是多少 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
5楼2020-07-21 23:01:38
yangyue5678
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3.4
- 散金: 286
- 帖子: 94
- 在线: 451.7小时
- 虫号: 1990611
- 注册: 2012-09-10
- 专业: 中药质量评价
6楼2020-07-22 21:50:01
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 586 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26316.1
- 红花: 348
- 帖子: 2021
- 在线: 1440.5小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
7楼2020-07-22 23:56:27
yangyue5678
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3.4
- 散金: 286
- 帖子: 94
- 在线: 451.7小时
- 虫号: 1990611
- 注册: 2012-09-10
- 专业: 中药质量评价
8楼2020-07-24 17:10:18
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 586 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26316.1
- 红花: 348
- 帖子: 2021
- 在线: 1440.5小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
9楼2020-07-24 20:13:06