应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 分子结构优化之前如何扫描
51/1返回列表
查看: 2312  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

yangyue5678

铜虫 (小有名气)

[求助] 分子结构优化之前如何扫描 已有2人参与

求助各位大神，我做了个分子结构优化，有条审稿意见是
The studied molecule can present several minina, a scan on the dihedral angle 4-3-10-15 is necessary before proceeding to the other calculations.
请问这个scan要怎么做呢？谢谢大家
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2020-07-21 18:54:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangyue5678

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-07-21 23:01:38
所谓扫描的意思是 高斯按照你设置的变量 每隔一个角度或者长度算一次能量然后把它们画成一张图。你可以看到能量随着你扫描的变量变化的曲线 这个曲线出现的低点就是可能存在的稳定结构 。你把所有可能的稳定结构都做 ...

版主的回复对我帮助很大，非常感谢，现在迷惑的是我用B3LYP/6-311G扫描势能在-1992左右，而用b3lyp/lanl2dz扫描的势能在-656左右，基组不同，势能会差异这么大吗？
赞一下 回复此楼
6楼2020-07-22 21:50:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

天天进步啊

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yangyue5678: 金币+15, ★有帮助, 有用 2020-07-21 22:41:38
在gjf文件里用内坐标，不要用直角坐标，然后用关键词opt=modredundant，末尾加上二面角的扫描范围
赞一下 回复此楼
分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777
2楼2020-07-21 20:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yangyue5678: 金币+35, ★★★很有帮助 2020-07-21 22:43:11
具体方法可以看我这个教程的1.10.3节  https://muchong.com/t-14242735-1，具体如截图。

同时这个帖子的附件6就是一个如何用GaussView设置柔性扫描的动图。
分子结构优化之前如何扫描
QQ截图20200721091154.png
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

yangyue5678
3楼2020-07-21 21:16:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangyue5678

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-07-21 21:16:31
具体方法可以看我这个教程的1.10.3节  https://muchong.com/t-14242735-1，具体如截图。

同时这个帖子的附件6就是一个如何用GaussView设置柔性扫描的动图。

QQ截图20200721091154.png
...

你好，请问扫描的目的是什么，扫描完之后需要做什么呢？
赞一下 回复此楼
4楼2020-07-21 22:42:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 283求调剂 +6 小楼。 2026-03-12 9/450 2026-03-14 22:15 by cfxczx2015
[考研] 347求调剂 +3 vevee 2026-03-08 3/150 2026-03-14 03:38 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 清风问长安 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:15 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:14 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 求调剂（材料与化工327） +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大，材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 268求调剂 +4 好运连绵不绝 2026-03-12 4/200 2026-03-13 10:45 by hyswxzs
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考研] 0817学硕华东区求调剂 +3 30660438 2026-03-08 3/150 2026-03-10 16:55 by Pegasus0429
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
[考研] 求0856调剂 +5 小力气珂珂 2026-03-08 5/250 2026-03-09 06:42 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭