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yangyue5678铜虫 (小有名气)
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分子结构优化之前如何扫描 已有2人参与
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求助各位大神，我做了个分子结构优化，有条审稿意见是 The studied molecule can present several minina, a scan on the dihedral angle 4-3-10-15 is necessary before proceeding to the other calculations. 请问这个scan要怎么做呢？谢谢大家 |
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yangyue5678
铜虫 (小有名气)
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送红花一朵 
4楼2020-07-21 22:42:59
天天进步啊
木虫 (著名写手)
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2楼2020-07-21 20:53:55
paramecium86
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【答案】应助回帖
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yangyue5678: 金币+35, ★★★很有帮助 2020-07-21 22:43:11
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yangyue5678: 金币+35, ★★★很有帮助 2020-07-21 22:43:11
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具体方法可以看我这个教程的1.10.3节 https://muchong.com/t-14242735-1，具体如截图。 同时这个帖子的附件6就是一个如何用GaussView设置柔性扫描的动图。  QQ截图20200721091154.png |
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3楼2020-07-21 21:16:31
paramecium86
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| 所谓扫描的意思是 高斯按照你设置的变量 每隔一个角度或者长度算一次能量然后把它们画成一张图。你可以看到能量随着你扫描的变量变化的曲线 这个曲线出现的低点就是可能存在的稳定结构 。你把所有可能的稳定结构都做一次结构优化 算出来能量 比较一下谁高谁低 或者用boltzman distribution算算看每一个稳定结构的占比是多少 |
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5楼2020-07-21 23:01:38
