| 查看: 749 | 回复: 8 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】如何准备'receptor.msv'文件---用DS做dock
|
|||
|
从网上下了一个'PDB'文件,内含小分子,将小分子和水删除后,保存; 准备做对接;当在对其定义时,出现如下对话框: "The selected molecule contains alternate conformations. You should remove the alternate conformations before defining it as a receptor";不知如何进行; 但有的PDB文件就没有,如1M52; 不知何故; 初学DS,有知道的内行,请帮忙告知: 1.下面如何做? 2. 什么原因? 多谢了! [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:27 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
药学求调剂
已经有12人回复
-
一志愿沪9，生物学326求调剂
已经有3人回复
-
307中医考研调剂
已经有3人回复
-
271求调剂
已经有31人回复
-
291求调剂
已经有4人回复
-
山东省基金2026
已经有11人回复
-
一志愿华中农业071010，320求调剂
已经有10人回复
-
材料工程281还有调剂机会吗
已经有43人回复
-
291求调剂
已经有5人回复
-
085801电气专硕272求调剂
已经有18人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2009-06-16 09:22:37
gwdavid
木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.522
- 金币: 4097.7
- 散金: 1548
- 红花: 57
- 帖子: 1768
- 在线: 151.2小时
- 虫号: 514002
- 注册: 2008-02-28
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
3楼2009-06-16 12:55:01
guoyingnba
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 贵宾: 0.1
- 金币: 1166.7
- 散金: 100
- 红花: 4
- 帖子: 196
- 在线: 58小时
- 虫号: 598924
- 注册: 2008-09-11
- 性别: MM
- 专业: 生物大分子结构与功能
4楼2009-06-17 09:02:05
5楼2009-06-17 09:45:02
qixingbao07
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 4
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4025.6
- 红花: 6
- 帖子: 595
- 在线: 164.1小时
- 虫号: 551931
- 注册: 2008-04-28
- 专业: 药物设计与药物信息
6楼2009-06-17 10:08:57
7楼2009-06-19 09:48:31
Movchan
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1397.6
- 散金: 868
- 红花: 2
- 帖子: 900
- 在线: 106.3小时
- 虫号: 410528
- 注册: 2007-06-23
- 专业: 化学计量学与化学信息学
|
我在做“定义蛋白配体”的时候，出现下述提示：“ The specified receptor has incomplete valence atoms that could affect the calculation. Create a Valence Monitor from the Structure menu to highlight these atoms.“ 请问这是什么意思，如何解决？谢谢！ 另外，删除小分子和水，是不是就是在CELL里不勾选就可以啊？唉，苦于没有如SYBYL自带的教程可以对照着熟悉，请高手指点！ [ Last edited by Movchan on 2009-7-30 at 11:40 ] |
8楼2009-07-30 11:37:56
lijianyong
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 845.9
- 散金: 574
- 红花: 2
- 帖子: 620
- 在线: 239.2小时
- 虫号: 359751
- 注册: 2007-04-29
- 性别: GG
- 专业: 生物医学传感
9楼2009-07-31 15:45:03
