24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 750  |  回复: 8
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yaohua009

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何准备'receptor.msv'文件---用DS做dock

从网上下了一个'PDB'文件,内含小分子,将小分子和水删除后,保存; 准备做对接;当在对其定义时,出现如下对话框:
"The selected molecule contains alternate conformations.
You should remove the alternate conformations before defining it as a receptor";不知如何进行; 但有的PDB文件就没有,如1M52; 不知何故;
初学DS,有知道的内行,请帮忙告知:
1.下面如何做?  
2. 什么原因?

多谢了!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:27 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qixingbao07

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢意见 6-17 10:10
你要把hetama删除掉才行,还有检查蛋白质是否完整
6楼2009-06-17 10:08:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

yaohua009

木虫 (著名写手)

对分子加力场时,出现如下对话框:"There was an error applying the forcefield: The molecule has alternative conformers, which cannot be typed by this forcefield.
You should remove the alternative conformers before typing.".
2楼2009-06-16 09:22:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎交流 6-17 10:10
我是做对接的,但不用dock,dock提示的错误也不是太熟,帮你顶一下吧
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
3楼2009-06-16 12:55:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guoyingnba

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):欢迎交流 6-17 10:10
你说的这个问题好像是DS里面的,DOCK里也有这样的问题啊?我知道在DS里面怎么解决。
4楼2009-06-17 09:02:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271求调剂 +35 2261744733 2026-04-11 41/2050 2026-04-14 15:36 by zs92450
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +24 好好休息好不好 2026-04-09 27/1350 2026-04-13 22:22 by pies112
[基金申请] 有爆料,一个青年教师卖房得400万,然后换了一个四青帽子 +11 babu2015 2026-04-08 11/550 2026-04-13 16:33 by probebill
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +12 emokidd 2026-04-08 13/650 2026-04-13 08:32 by lhj2009
[考研] 344 材料专业 求调剂211 无地域要求 +8 hualkop 2026-04-11 8/400 2026-04-12 22:24 by fqwang
[考研] 339求调剂 +8 hanwudada 2026-04-11 9/450 2026-04-12 15:36 by laoshidan
[考研] 药学专硕调剂 +8 ? 一路生?花? 2026-04-10 10/500 2026-04-11 21:21 by zhouxiaoyu
[考研] 352 求调剂 +6 yzion 2026-04-11 8/400 2026-04-11 16:24 by 明月此时有
[考研] 中药学调剂 初试324 +4 洋甘菊、 2026-04-10 6/300 2026-04-11 09:41 by gong120082
[考研] 材料与化工调剂 +12 否极泰来2026 2026-04-10 13/650 2026-04-11 00:28 by wangjihu
[考研] 考研调剂 +26 硕星赴 2026-04-09 27/1350 2026-04-10 22:24 by 猪会飞
[考研] 中科院总分315求调剂 +8 lallalh 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:30 by dick_runner
[考研] 284求调剂 +9 让我上岸吧阿西 2026-04-09 11/550 2026-04-10 19:18 by 靖jing
[考研] 一志愿京区985,085401,与本科专业一致,电子信息工程, +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 344求调剂 +7 丶风雪夜归人丶 2026-04-09 7/350 2026-04-10 12:05 by pengliang8036
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 085501机械英二77总分294求调剂,接受跨专业学习 +6 守法公民亓纪 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:55 by wp06
信息提示
请填处理意见