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cjw_0926

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助:大肠杆菌red同源重组一直出现假阳性 已有3人参与

最近一直在做red同源重组,将外源基因整合至K-12大肠杆菌染色体组上,电转后能长出菌落,但验证全都是假阳性线性
1.我用的是链霉素筛选,不知道是不是因为抗生素原因导致这么多假阳性?
2.我的整合片段较大有4000bp做有,同源臂选的是50bp,会不会太短,我是否需要延长同源臂长度?但查阅文献感觉K系列菌株50bp貌似足够了
3.是不是我挑的菌落太少?板上长了很多,但我来来回回也挑了有四五十个了,但一直都是假阳性,而且我在新的链霉素抗性板上划线,虽然假阳性但也能长起来。。
我的试验步骤:
以质粒为模板扩增打靶片段,DpnI消化后浓缩到260ng/uL打靶片段。
电转感受态细胞制备,预冷纯水洗一次,10%甘油洗两次,最后分装100ul每管,电转加入5ul片段
电击后加入1ml SOC培养基,170rpm 3h,离心浓缩到100ul涂板,37℃培养16h
菌落PCR是在整合片段上下游200bp开外

求各位大神指导!在这个基因上耗了太长时间了,要崩溃了。。。。
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4017

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主,你好,能不能惠赠我一点K-12大肠杆菌
2楼2019-04-27 18:22:32
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mengqiang327

银虫 (初入文坛)

根据你的描述,建议做一个K-12的耐药性试验,将链霉素稀释成不同的工作浓度,可能工作浓度调高一点假阳性就少了。

发自小木虫Android客户端
胸膛走在思想前面的烟酒僧
3楼2019-05-04 12:45:12
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成事想心

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主你好。我目前也在做同源重组。是将一个基因片段接入一个质粒上面,目前已经通过电泳证实载体和目标片段连在一起了。但就是筛选阳性克隆子时都是假阳性。现在也不知道怎么回事。希望有大佬可以帮忙解答。如果楼主解决了相应的困惑,我们也可以交流一下。感谢。
4楼2019-09-19 11:46:29
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匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
5楼2019-09-19 21:23:07
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寒冬夜寂

新虫 (小有名气)

楼主你好,我也在做这方面的研究,不知道能否加楼主的QQ询问一些问题,谢谢楼主了
6楼2019-12-17 17:20:48
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2339773049

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 小木无虫 at 2019-09-19 21:23:07
我有k12菌
...

价格是?
7楼2020-08-20 21:37:50
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donkey2017

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 4017 at 2019-04-27 18:22:32
楼主,你好,能不能惠赠我一点K-12大肠杆菌

我有K-12 MG1655, 需要可以私信
8楼2020-08-21 09:13:30
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donkey2017

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 2339773049 at 2020-08-20 21:37:50
价格是?

我有K-12 MG1655,需要可以私信
9楼2020-08-21 09:13:53
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