应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 能否用FPKM筛选差异基因
61/1返回列表
查看: 2700  |  回复: 5
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者lijlsdau将赠送您 80 个金币

lijlsdau

新虫 (著名写手)

[求助] 能否用FPKM筛选差异基因已有2人参与

公司给的差异基因是通过readcount计算出来的，FPKM相当于对count进行了标准化，那么我们能否直接用FPKM筛选差异基因呢，用exel的T-test检验寻找差异基因？

@biostar2009 @wizardfan 发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
耐心、细心、用心
1楼2019-03-01 16:36:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欧易 李炼

新虫 (小有名气)
哪个公司给的？

发自小木虫Android客户端
回复此楼
2楼2019-03-01 19:09:20
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lijlsdau

新虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 欧易 李炼 at 2019-03-01 19:09:20
哪个公司给的？

华大基因

发自小木虫Android客户端
回复此楼
耐心、细心、用心
3楼2019-03-01 19:41:36
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lijlsdau(渊博震天代发): 金币+20, 鼓励积极回帖 2019-03-02 14:44:47
不够，你还要normalize到看家基因或者用deseq
FPKM会受测序深度影响
赞一下 回复此楼
Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
4楼2019-03-01 23:35:15
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

酱油托儿所

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以是可以，但是还需要做一些数据质控的工作，还是再看一下有没有别的整理好的数据，或者在网上学习一下把数据转化的方法吧，不然就像上面的老师说的，有测序深度的影响
赞一下 回复此楼
生物信息数据挖掘爱好者
5楼2019-03-04 09:14:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欧易 李炼

新虫 (小有名气)
FPKM是一个参考标准，但不是唯一的

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2019-03-04 15:22:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lijlsdau 的主题更新
61/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫 SCI英文润色翻译-EnPapers美团队-先修改后付款
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 试用期辞职 +7 ZHONGWU_U 2024-06-18 9/450 2024-06-18 21:42 by 3001160025
[基金申请] 2024国社科通讯评审 +16 qsd10086 2024-06-13 33/1650 2024-06-18 21:29 by 全球漂
[硕博家园] 豫北虫友互识 +6 xuhongli903 2024-06-18 6/300 2024-06-18 21:12 by 张同学。
[找工作] 初始合伙人来啦！（生物试剂耗材标准品） +14 欢快的小科研人 2024-06-15 25/1250 2024-06-18 20:35 by 小飞来虫
[基金申请] 江南大学到瑞士招聘，称取消非升即走，改预聘+长聘 +16 babu2015 2024-06-18 16/800 2024-06-18 18:48 by bioalchem
[基金申请] F口信息学部拿面上，大概需要什么样的成果 +7 _奋黎_ 2024-06-16 13/650 2024-06-18 17:20 by _奋黎_
[找工作] 药学硕士找不到工作，打算去做科研助理了 +6 pom戴墨镜 2024-06-14 19/950 2024-06-18 13:06 by lialee22
[精细化工] 试剂价格 +3 旭必上岸 2024-06-17 3/150 2024-06-18 09:13 by kzx_33
[有机交流] 苯酚和炔醇反应，mitsunobu反应 5+3 TONGMEIMEI 2024-06-12 9/450 2024-06-17 15:00 by dschong
[教师之家] 每次骚扰女学生的都是院系领导，而不是普通教师，小编们要注意措辞正确 +9 zju2000 2024-06-15 11/550 2024-06-16 14:49 by appleapple2
[论文投稿] 二审返修送审10天了，原来一审的3个审稿人只有2个接受了审稿，会邀请新审稿人么？ 50+3 huanpo116 2024-06-15 5/250 2024-06-16 10:27 by bobvan
[论文投稿] 投稿被一个审稿人恶意评审了怎么样？ +5 1chen 2024-06-14 7/350 2024-06-15 23:15 by xy66xy
[基金申请] 关于博后基金的bug问题 +6 lxr1991 2024-06-14 9/450 2024-06-15 21:17 by since—2010
[基金申请] 为什么我的博后基金还在流动站审核中？不会是学院给我卡了吧？ +14 王凯12 2024-06-13 26/1300 2024-06-15 15:22 by 好人与坏人
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+3 迷茫小旷 2024-06-14 4/200 2024-06-15 11:25 by bobvan
[基金申请] 博后基金，以往的结果点不开，怎么回事呢？最后一次机会了，两次都没中前面。 +7 kyukitu 2024-06-14 13/650 2024-06-15 06:46 by 我是王小帅
[有机交流] ππ堆积会发生在有机溶剂中吗 5+3 zibuyu0420 2024-06-13 4/200 2024-06-14 14:17 by 小肉干
[硕博家园] 机械研究生如何拿到年薪40+w +13 阿巴阿巴哦哦 2024-06-11 15/750 2024-06-13 15:40 by 113745685
[有机交流] 原料反应完了，怎么知道是产物还是中间体 +6 小胡在努力 2024-06-11 8/400 2024-06-13 13:33 by 091602
[硕博家园] 申博 +3 悦悦小小鱼 2024-06-12 3/150 2024-06-12 15:11 by chen5805
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭