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lijlsdau

新虫 (著名写手)

[求助] 能否用FPKM筛选差异基因已有2人参与

公司给的差异基因是通过readcount计算出来的,FPKM相当于对count进行了标准化,那么我们能否直接用FPKM筛选差异基因呢,用exel的T-test检验寻找差异基因?

@biostar2009 @wizardfan 发自小木虫Android客户端
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酱油托儿所

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以是可以,但是还需要做一些数据质控的工作,还是再看一下有没有别的整理好的数据,或者在网上学习一下把数据转化的方法吧,不然就像上面的老师说的,有测序深度的影响
生物信息数据挖掘爱好者
5楼2019-03-04 09:14:53
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