已入驻小木虫 
| 查看: 2391 | 回复: 121 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 kspm20225 的 63 个金币 ，回帖就立即获得 1 个金币，每人有 1 次机会 | |||
[商家供应]
天然产物分子机制研究——药物靶点预测系统案例分析2
|
|||
|
药物靶点预测系统案例分析1 化合物的活性寻找是一件让人费心费力的事情，尤其天然产物研究人员对此更是捉急万分。虽然不少研究人员使用活性导向的提取分离方法，但往往只能验证天然产物的表型活性，无法确定其作用靶点或通路。 药理研究人员也是有此困惑，即使某化合物表型活性很好，却依旧无可奈何——只能按照常规思路，筛选常见的活性通路或者靶点，往往大海捞针，雾里看花终不知其貌。  进入主题： 抗肿瘤血管生成靶点的寻找 血管内皮生长因子（vascular endothelial growth factor，vegf）是一种高度特异性的促血管内皮细胞生长因子【1】，在血管的生成过程中扮演着重要的作用，包括内皮细胞增殖、迁移、血小管生成、血管通透性增强等【2】。 最重要的是：vegf是肿瘤血管生成的关键介质【3】，因此，靶向vegf/vegfr的抗肿瘤药物研究也曾是热点之一。现有的药物包括诺华帕唑帕尼、拜耳 /onyx 索拉菲尼、辉瑞舒尼替尼或罗氏贝伐单抗（ps，贝伐2014年的销售额超过70亿美元）。然而，现有血管生成抑制剂面临着耐药性及毒性的巨大挑战。  vegf（pdb：3wze） 最近，来自韩国的jong seog ahn等研究员从一种链霉菌（sp. rk88-1441）分离出一个新的糖基化的蒽醌类化合物aturanoside b，其对人脐静脉血管内皮细胞没有毒性，但明显抑制vegf诱导的血管生成和浸润。同时也观察到化合物aturanoside b可使血管内皮生长因子受体2的磷酸化和血管内皮钙粘蛋白的表达下调【4】。  为了验证化合物aturanoside b是否通过靶向vegf/vegfr抑制血管生成，小编使用药物靶点预测系统（dtps）进行预测。操作相当简单，通过内置的结构编辑器ipmdraw在线绘制结构或者直接导入本地分子结构文件即可提交任务。  很遗憾，预测结果有两个——雌激素受体α（estrogen receptor alpha，erα）与雌激素受体β（estrogen receptor beta，erβ），没有发现化合物aturanoside b与vegf/vegfr有直接联系。  故事到此尚未结束： er与vegf 近些年来，不少研究表明雌激素受体在vegf基因转录上扮演着重要的作用。一篇发表于pnas的研究显示在子宫内膜细胞中，雌激素反应元件ere负责er诱导vegf基因的转录【5】。此外，更多研究证明在乳腺癌细胞中，er调控vegf基因的表达【6，7，8】。 基于此，我们是否可以推测——化合物aturanoside b通过作用于er，调控vegf下调，从而抑制血管生成和浸润？ 我们先来看看药物靶点预测系统是如何预测到化合物aturanoside b作用于er：基于二维相似的方法，化合物aturanoside b与系统中活性小分子库的化合物（70多万个）逐一比较，不到一分钟结果就出来了。最后发现一个与化合物aturanoside b非常相似的化合物lg000504005：  嗯，化合物aturanoside b与lg000504005确实很像，都具有一个蒽醌骨架及一个糖基。而化合物lg00504005于2001年已被证明对erα及erβ有一定的亲和力。基于相似性原理，我们有理由推测化合物aturanoside b可能作用于er，进而抑制vegf的表达，从而使血管生成减少。 结论： 综上所述，化合物aturanoside b可能作用于er。 ps：本文仅是推测，未经实验验证。。。。。。若是你基于本文进行实验验证或者进一步的计算验证，中了头彩，小编只求尾作。。。。。。 相关参考资料： [1]. ferrara, n., curr top microbiol, 1999. 237: p. 1-30. [2]. hanahan, d., et al., cell, 1996. 86(3): p. 353-64. [3]. carmeliet, p., oncology, 2005.693: p. 4-10. [4]. jang, j., et al., jnp, 2018.81(9): p. 2004-2009. [5]. mueller, m.d., et al., pnas, 2000. 97(20): p. 10972-10977. [6]. buteau-lozano, h., et al.,cancer research, 2002. 62(17): p. 4977-4984. [7]. kawai, h., et al., oncogene, 2002. 21(50): p. 7730-7739. [8]. stoner, m., et al., oncogene, 2004. 23(5): p. 1052-1063. [9]. matsuda, h., et al., bmcl, 2001. 11(14): p. 1839-1842. 该系统使用方便，无需安装，直接浏览器登录使用即可。试用网址 http://demo.dtps.iprexmed.com/#/index 联系邮箱 sales@iprexmed.com，请发送您的 “单位+课题组+个人姓名”到邮箱 或者联系-----联系人：爱菩新医药，qq 2277165792 微信 18928913950 联系电话 020-28100562 工作日期间客服人员将在24小时内为您开通 现处于推广期哈，重要的事情说三遍：免费！免费！免费！ 客服微信  [ Last edited by kspm20225 on 2019-6-18 at 19:08 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
海南大学国家级人才田新龙教授团队氢燃料电池与器件方向招收24级博士/助理 (重点支持)
已经有8人回复
-
谁要做个人网站，可以交流啊！
已经有29人回复
-
基金委也是打工的
已经有25人回复
-
浙江的高校现在门槛都这么高吗
已经有9人回复
-
优秀毕业论文 指导教师，普通老师有希望吗？
已经有4人回复
-
民办高校入职后稳定吗？
已经有15人回复
-
国自然青基把共同第一作者标成了唯一第一作者
已经有29人回复
-
连续3年国社科青年本子都没中，今年最后一次青年了，写本子完全浪费时间
已经有16人回复
-
绍兴文理学院怎么样？有没有坑啊
已经有10人回复
-
又见奇葩学生，可咋办
已经有19人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
替老弟发个帖--寻找有缘的她
+2/876
-
基金祈福
+1/285
-
诚征男友非诚勿扰
+1/119
-
siRNA转染试剂成功转染人肝癌细胞系
+1/90
-
坐标郑州及附近，诚征女友
+1/74
-
Jacs二审
+2/57
-
软包电池化成鼓包
+1/39
-
中国科学院过程工程研究所能源与环境催化课题组招聘研究助理启事
+1/37
-
招聘高校学院秘书
+1/31
-
南林大副教授未通过考核后自杀离世，生前退还部分安家费，转自凤凰网
+1/23
-
【香港城市大学】范战西教授课题组招收博士研究生（2025秋，全奖）
+1/22
-
浙大博后招聘、访学招聘---课题方向不限
+1/19
-
新乡医学院招聘：科研助理，待遇优厚
+1/13
-
找towhee同行交流
+1/9
-
做PMS过一硫酸盐的老师，希望能交流一下
+1/8
-
中科院地理所客座研究生招聘
+1/6
-
GSAS无法导入数据
+1/5
-
清华大学深圳国际研究生院-周学拳课题组诚聘博士后/科研助理/硕博
+1/5
-
法国实验室招收高分子专业博士生
+1/3
-
天津大学浙江研究院（宁波）诚聘博士后、特聘青年研究员
+1/3
+2/876
★
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
| 有 |
2楼2019-01-09 10:57:27
★
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
 |
3楼2019-01-09 14:44:30
★
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
| · |
4楼2019-01-09 16:15:27
★
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
 |
5楼2019-01-10 11:23:53
★
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
|
|
6楼2019-01-10 12:29:58
7楼2019-01-13 21:06:38
8楼2019-01-14 06:51:58
★
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
kspm20225(金币+1): 谢谢参与
|
|
9楼2019-01-16 22:16:11
liunahan
木虫之王 (文学泰斗)
- 应助: 118 (高中生)
- 金币: 106453
- 散金: 200
- 红花: 33
- 帖子: 87252
- 在线: 3980.4小时
- 虫号: 260314
- 注册: 2006-06-17
- 性别: GG
- 专业: 电化学
10楼2019-02-02 19:54:36
