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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 73 (初中生)
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性别: MM
专业: 理论和计算化学

[求助] MS 吸附模型如何消除层与层之间的空隙 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 已有1人参与

在MS里构建吸附模型时用到 build layer ，但是build layer之后的模型层与层之间总是存在一定距离的空隙。如图所示。

层与层之间的空隙有没有办法消除？

因为最下层是固体，计算的时候需要固定，那么就没有办法用NPT来调整模型的体积大小。如果不消除空隙，上面溶液的密度就变小了。后面再用NVT计算的话，模型就有问题了。

那么如何消除空隙？或者有更好的办法吗？请高手指点

MS 吸附模型如何消除层与层之间的空隙 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

adsorption.jpg

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1楼 2017-03-27 09:21:55

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轻化染整

新虫 (初入文坛)

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晶体从表面改为3d的时候改变真空度为0可以么

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8楼2017-03-29 16:51:08

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MS_Z

金虫 (初入文坛)

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专业: 化工热力学和基础数据

如果密度知道的话能否使用packmol直接建立模型呢？这样应该就不会有空隙了吧

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2楼2017-03-27 19:24:55

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匿名

用户注销 (小有名气)

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专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

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3楼2017-03-28 15:08:10

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飞天ssp

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hh

4楼2017-03-28 16:33:14

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