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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

[求助] 氨苄抗性的PUC18-3HA转化农杆菌GV3101问题 已有2人参与

又来求助了

如题,要证明转录因子对启动子的调控,采用pGREEN2-0800-LUC/REN双荧光系统,转录因子是构建到了PUC18-3HA载体上,是amp抗性的。按照操作要转入农杆菌GV3101,第一次抗性弄错了,没长,第二次用amp,整个板子都是,和抗生素失效的感觉一样,也查询了一下,似乎确实有人遇到这样的问题。

接下来要转的话,是要提高抗生素浓度呢,还是更换农杆菌菌株?请过来人指点一二,谢谢。下面是粘贴其他人的资源:


                                            标题: 请问有人将氨苄抗性的表达载体转入农杆菌吗?用的是哪种农杆菌呀?

摘要: [请问有人将氨苄抗性的表达载体转入农杆菌吗?用的是哪种农杆菌呀?] 我把氨苄抗性的表达载体转入农杆菌EHA105、GV3103中,结果12小时就都长了满满一板子,然后又试了下LBA4404,结果又不长。哪位大侠做过的话指导下我吧,我的烟草眼看就不能注射了! 关键词:[抗性 农杆菌 表达载体 载体 菌株 实验室 质粒]……
关键词: 抗性 农杆菌 表达载体 载体 菌株 实验室 质粒


我把氨苄抗性的表达载体转入农杆菌EHA105、GV3103中,结果12小时就都长了满满一板子,然后又试了下LBA4404,结果又不长。哪位大侠做过的话指导下我吧,我的烟草眼看就不能注射了!
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试试GV3101、EHA103看吧。不是很清楚。
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看质粒有没有整合区。没有的话要用90RK菌株用三抗筛选。氨苄 最好换成羧卞,加利福平 庆大霉素,我记得这个菌株有两个也不三个抗性。有点记不清了 这个菌株很难做,楼主再查查 。
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我们实验室也转化过氨苄抗性的,确实板会长的没法用,后来我们都改用卡纳抗性的载体了
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我们实验室也转化过氨苄抗性的,确实板会长的没法用,后来我们都改用卡纳抗性的载体了
不要这样啊,这不是要重做的节奏嘛,我好不容易做好的载体
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A4用了吗
没太看懂什么意思
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我们DH5a用的AMP,GV3101用的KANA,RIF,CARB,Mgcl2.
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用EHA105 将氨苄浓度提高四倍可以筛选出来。
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用EHA105 将氨苄浓度提高四倍可以筛选出来。
我正在做这种尝试,希望有用呀
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我们DH5a用的AMP,GV3101用的KANA,RIF,CARB,Mgcl2.
谢谢你,我借个GV3101试试。
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谢谢你,我借个GV3101试试。...
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)

yudaoqian88: 回帖置顶 2017-02-14 09:54:14
amp容易变坏,要新鲜配置,不能太多水汽。有一个amp替代物,carbenicilin 以后可以尝试

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
4楼2017-02-14 07:44:48
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chiangscn

银虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2017-02-15 07:53:51
我不常上小木虫,但是,每当我看到有人问类似的问题,我就有点担忧。
按理说,导师应该是学生的指导人,是有一定学术水平、有过科班训练、发表过有一定水准的SCI论文、并且能够提供有益的指导、避免缺少或者无经验的学生或下属走弯路的带头人。可惜,国内外,有很多导师并不称职,并不配作为硕士或博士导师,科研已经成为个人捞取名利的手段,全无应有的风度与做派。导致师生反目、学生厌学或抑郁的事情,常有发生。所以,学生选导师,不要看称号、不要看学校,而要看导师本身的水准与实验室条件以及人品。即使你是哈佛毕业的,没有独立一作的拿得出手的论文,你照样没法在科研领域里生存。 早些年,只要你是所谓的名校毕业的,没有本事的混混也能拿到好待遇,现在是:不以出身论英雄,也算是一点进步,给底层一点鼓励吧。

我想说的是,从你的载体名可以看出,我猜失败的主要的原因是:你用的是原生质表达用的pUC载体,并不含有T-DNA区等农杆菌载体的特点,故不能在农杆菌里使用。正确的是更换effector质粒为pCAMBIA系列的质粒或者pBI121系列的质粒。我实验室的学生几年过犯过一个类似的错误,被我及时发现阻止了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

wholaughslastlaughsbest
8楼2017-02-14 22:43:21
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Lau_Kimura

铁虫 (正式写手)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-02-14 07:45:54
管它长多长少,有没有挑菌做菌落PCR验证,看有没有转进去。你验证过是不是假阳性了吗?

要验证抗生素是否失效,可以直接用感受态涂板,作为阴性对照的。

新手做实验哪能不设计对照组的呢?你老板知道看打不打死你。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-02-14 03:32:12
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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by chiangscn at 2017-02-14 22:43:21
我不常上小木虫,但是,每当我看到有人问类似的问题,我就有点担忧。
按理说,导师应该是学生的指导人,是有一定学术水平、有过科班训练、发表过有一定水准的SCI论文、并且能够提供有益的指导、避免缺少或者无经验 ...

非常感谢这位老师的帮助。

我硕士博士都在同一个研究所读的,所以对其他实验室了解的不多。前段时间由于实验需要,有幸去中科院植物所一个老师那里学习实验,看到人家的培养模式确实不一样,基本上是小组性质的,一个导师手下有一到两名助理,往下就是学生,导师基本同学生一样来往于实验室,能够给予具体的实验指导。当然,这些大牛的实验室有丰富的科研积淀,有成熟的实验体系,实验路线和技术是我们这些底层实验室所不能比拟的。

我们的情况类似于金字塔,塔尖是老板,是导师,依靠位置优势搞合作拿项目。往下面是小老师,负责课题基本科研事物,基金申请,结题等等等等。学生也是这部分人负责的。但老师们真的是忙呀,导师就更不用说了。在学术水平上,导师更多的是指导方向,具体的实验导师们自己都摇头的,这点无可厚非。小老师们会给学生一些指导,但课题的杂活是在太多,每来一个新人都忙到手足无措。所以具体实验上的指导就别提了,都是学生自己摸索吧。因为老师们不用下实验室,所以脱节了。

我们虽然在学术上没啥成果,但导师本人对我们要求还是挺严格的,开题以及平时汇报都会尽可能邀请专家来指导,这点我们很感激。也听过很多科研院所,相比之下,我们这里对学生的指导帮助,对学生态度等方面算是不错的,有的地方更惨。

再次感谢老师的帮助
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10楼2017-02-14 23:38:35
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方天翼614

新虫 (小有名气)

正在学习这方面的:请问是不是还要设计个不含有AMP的培养基作为对照啊,还是需要设计个同时含有X-Gal啊?

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2017-02-14 05:03:39
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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by Lau_Kimura at 2017-02-14 03:32:12
管它长多长少,有没有挑菌做菌落PCR验证,看有没有转进去。你验证过是不是假阳性了吗?

要验证抗生素是否失效,可以直接用感受态涂板,作为阴性对照的。

新手做实验哪能不设计对照组的呢?你老板知道看打不打 ...

谢谢你的帮助,俺老板不知道呢!
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5楼2017-02-14 09:58:01
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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 方天翼614 at 2017-02-14 05:03:39
正在学习这方面的:请问是不是还要设计个不含有AMP的培养基作为对照啊,还是需要设计个同时含有X-Gal啊?

谢谢你的帮助,这个应该不需要IPTG,X-GAL这些辅助的重组质粒选择体系
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6楼2017-02-14 09:59:57
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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by drwhoknowss at 2017-02-14 07:44:48
amp容易变坏,要新鲜配置,不能太多水汽。有一个amp替代物,carbenicilin 以后可以尝试

谢谢你的提醒,很有帮助哈
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7楼2017-02-14 10:00:22
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chiangscn

银虫 (正式写手)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-02-15 07:54:12
或者,你干脆还是用pUC-3HA做effector质粒,但是转而采用原生质体做这个实验,肯定能行,有人发表论文就是这么做的。即:绕开不用农杆菌!刚开始,我也不太明白,后来知道reporter plasmid并不大,只有7 kb,用于原生质没问题。
wholaughslastlaughsbest
9楼2017-02-14 22:46:13
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