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汕头大学海洋科学接受调剂
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md模拟

新虫 (初入文坛)

[求助] 在lammps中怎么在模拟体系最顶端定义一个原子啊 已有2人参与

求大神给说一下,用lammps软件在整个模拟体系中怎么人为选取一个原子,是要用坐标来表示吗在手册中可以查到吗

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md模拟

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gredream at 2016-12-03 22:44:48
id

谢谢没看到,用group id的话,怎么知道原子的位置信息呢,我是用的lammps建的模型,希望能帮助一下

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3楼2016-12-05 14:49:55
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gredream

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

2楼2016-12-03 22:44:48
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gredream

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

4楼2016-12-05 14:58:04
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md模拟

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gredream at 2016-12-05 14:58:04
VMD里看呀,用 0<x and x<1 and y>10 and y<21 and z>15 and z<16选择到你想看的原子,找到id的编号,让group id 他在in文件中选中...

就是说先在lammps中建立模型之后,直接运行就可以在vmd中看到了吗,直接打你刚才的命令就可以了?一直在搞这个不知道怎么弄,谢谢帮助大神

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5楼2016-12-05 17:45:26
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