24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 5081  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

菱紫369

铜虫 (初入文坛)

[求助] 怎样用一段基因和基因组的序列进行比对呢?

求助:我想要做一个苜蓿的基因定量,可是没有序列不能设计引物,所以想拿拟南芥的这个基因和苜蓿的基因组进行比对,得到序列后设计引物,可是不知道这么做对不对,还有不知道怎么比对?如果想法不对请知道的大神指点!急急急!有谁知道请帮忙,万分感谢!

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

菱紫369

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by ygidtu at 2016-10-16 20:13:10
可以的,跑一个blast看一下亲缘性应该就可以,看拟南芥的那段序列到底和你要的那个基因匹不匹配
...

哦哦,貌似我还没找到,比对不出来呢!

发自小木虫Android客户端
8楼2016-10-16 20:15:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

ygidtu

新虫 (正式写手)

看一下序列相似度,相似程度够高,应该可以做一下试一试

发自小木虫Android客户端
2楼2016-10-16 19:38:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ygidtu

新虫 (正式写手)

至于比对的话,先找一下有没有苜蓿的基因组数据再说吧

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-10-16 19:39:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

李保磊

金虫 (著名写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-10-16 22:22:38
可以先去NCBI将苜蓿的序列全部下载下来,然后blast,这样才可靠,你要是拟南芥的话,必须找一些保守区域,也有可能出现问题,而且费些时间

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

做最棒的自己!!
4楼2016-10-16 19:42:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学070300-总分378-求调剂 +5 挪椅子的泡泡糖 2026-04-02 5/250 2026-04-02 22:20 by ZXlzxl0425
[考研] 材料调剂 +7 一样YWY 2026-04-02 7/350 2026-04-02 21:49 by dongzh2009
[考研] 260求调剂 +6 朱芷琳 2026-04-02 6/300 2026-04-02 20:27 by 6781022
[考研] 085600,材料与化工321分求调剂 +11 大馋小子 2026-03-28 11/550 2026-04-02 15:59 by yunlongyang
[考研] 化学308分调剂 +14 你好明天你好 2026-03-30 15/750 2026-04-02 13:39 by 嘻嘻笑22
[考研] 290求调剂085701 +3 1314捧花 2026-04-02 3/150 2026-04-02 13:34 by Ecowxq666!
[考研] 270求调剂 +8 小杰pp 2026-03-31 10/500 2026-04-02 12:57 by yulian1987
[考研] 327求调剂 +9 汲亦昊 2026-03-29 9/450 2026-04-02 11:44 by 运气yunqi
[考研] 270调剂 +7 maxjxbsk 2026-04-02 7/350 2026-04-02 09:50 by yulian1987
[考研] 292求调剂 +17 木虫er12138 2026-04-01 17/850 2026-04-01 21:37 by 七度不信任
[考研] 求调剂 +4 DADA怪 2026-03-31 4/200 2026-04-01 14:30 by ZXlzxl0425
[考研] 求调剂:一志愿:南京大学 专业:0705 总分320 ,本科985,四六级已过 +3 lfy760306 2026-03-31 3/150 2026-04-01 01:57 by Creta
[考研] 0856求调剂 +9 楒桉 2026-03-28 9/450 2026-03-31 19:06 by 暮泽12
[考研] 286求调剂 +6 Faune 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:37 by jp9609
[考研] 一志愿大连理工大学,机械工程学硕,341 +3 西瓜田的守望者 2026-03-30 3/150 2026-03-31 11:08 by asdfzly
[考研] 085701环境工程求调剂 +11 多久上课 2026-03-27 12/600 2026-03-30 21:21 by 研究僧导导
[考研] 11408总分309,一志愿东南大学求调剂,不挑专业 +5 天赋带到THU 2026-03-29 6/300 2026-03-30 20:49 by dick_runner
[考研] 283求调剂(080500) +14 A child 2026-03-27 14/700 2026-03-30 12:06 by 探123
[考研] 本科新能源科学与工程,一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 调剂 +3 李嘉图·S·路 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:19 by wangjy2002
信息提示
请填处理意见