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怎样用一段基因和基因组的序列进行比对呢？
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求助：我想要做一个苜蓿的基因定量，可是没有序列不能设计引物，所以想拿拟南芥的这个基因和苜蓿的基因组进行比对，得到序列后设计引物，可是不知道这么做对不对，还有不知道怎么比对？如果想法不对请知道的大神指点！急急急！有谁知道请帮忙，万分感谢！ 发自小木虫Android客户端 |
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可以先去NCBI将苜蓿的序列全部下载下来，然后blast，这样才可靠，你要是拟南芥的话，必须找一些保守区域，也有可能出现问题，而且费些时间 发自小木虫Android客户端 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
4楼2016-10-16 19:42:20
ygidtu
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15楼2016-10-19 16:29:04
ygidtu
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3楼2016-10-16 19:39:29
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不下载下来比，用NCBI在线的双序列比对可以吗？怎么区分是保守区域还是不保守区域呢？我用在线的双序列比对拿拟南芥的几丁质酶基因和蒺藜苜蓿的全基因组比对，没比对出来！我这m做是不是不对啊…… 发自小木虫Android客户端 |
5楼2016-10-16 20:01:08
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ygidtu
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