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mimi_pudding金虫 (小有名气)
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[求助]
求助 全基因组测序后 多位点序列分型/分析MLST/MLSA 已有1人参与
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我们有一篇文章投稿，做的是：分离得到一株贪铜菌Cupriavidus菌，通过16S鉴定为贪铜菌属，后续做降解性能呀之类的很多 现在审稿意见认为，菌种鉴定应该补做MLSA。请问是现在16S已经认为不足以说明问题了么？ 我们这株菌已经做了全基因组测序，我的基因组中可以搜索到atpD, glnII, recA等多个housekeeping genes。想请问后续应该怎么做MLSA? 据说需要在一些pubmlsa等网站比对，但是我没有看到有贪铜菌属相关的标准菌株，请问可以做么？ 修改时间紧急，我也着急。 谢谢大家！！ |
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