24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3208  |  回复: 27
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

天下为公5592

铜虫 (著名写手)

[交流] 【求助】新手请教分子模拟问题 已有5人参与

我想做氨基酸或多肽在方解石表面的动力学模拟,用哪个软件比较好?

我只知道人家有用Material Studio做模拟的。

还有个问题是:蒙特卡罗模拟到底是用什么软件?是自己编程的吗?

谢谢指点!

[ Last edited by zdhlover on 2009-12-14 at 14:19 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天下为公5592

铜虫 (著名写手)

请问:是用C语言编写吗?用什么软件编程呢?
3楼2008-11-23 10:37:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 28 个回答

fansw1129

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
蒙特卡罗是一种方法
如果搞的好的话,可以做很多的工作
现在需要自己写程序
2楼2008-11-23 08:48:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天下为公5592

铜虫 (著名写手)

十分感谢您的回答,对我启发很大,我想做方解石晶体表面与氨基酸的分子动力学模拟,你说哪个软件比较适合呢?
5楼2008-11-23 13:21:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
csfn(金币+2,VIP+0):3q
因为我只是用过分子动力学模拟,这不是我的主要研究内容,因此也就并没有比较所有这些分子动力学模拟软件的优劣。但是有一点我可以说,其实每个分子动力学模拟软件的实现的“理论”都是一样的,它们之间的不同很大程度上是由于采用的分子力场的不同。
因此我的建议是尽量去选择合适你的研究体系的分子力场,比如说像倾向于蛋白质研究而开发的cvff, amber力场等很可能就不是最适合你的研究体系的。然后再根据这个力场去选择软件,这是一种考察方式和选择方法,仅供参考。
对于你的体系我没有发言权,对于分子动力学软件比较我也没有发言权,有赖于你自己去考察,仅希望愚见能对你有所帮助
个人博客:[url]http://blog.sina.com.cn/gaiwei[/url]
6楼2008-11-23 13:38:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研英一数一338分 +6 长江大学东校区 2026-04-13 7/350 2026-04-13 09:40 by fqwang
[考研] 346分,工科0854求调剂,专硕 +6 moser233 2026-04-12 7/350 2026-04-12 22:11 by fqwang
[考研] 一志愿华中农微生物,288分,三年实验经历 +11 代fish 2026-04-09 11/550 2026-04-12 10:21 by Hayaay
[考研] 305求调剂 +7 玛卡巴卡boom 2026-04-11 7/350 2026-04-12 07:35 by zhouxiaoyu
[考研] 296求调剂 +8 汪!?! 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:02 by 逆水乘风
[考研] 352 求调剂 +6 yzion 2026-04-11 8/400 2026-04-11 16:24 by 明月此时有
[考研] 296求调剂 +6 汪!?! 2026-04-09 6/300 2026-04-11 11:25 by zhq0425
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 一志愿东北大学控制工程085406数二英二385,求调剂 +8 Ezra_Zhang 2026-04-09 8/400 2026-04-11 09:15 by 猪会飞
[考研] 284求调剂 +12 archer.. 2026-04-10 13/650 2026-04-11 08:44 by zhq0425
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[考研] 266求调剂 +29 阳阳哇塞 2026-04-07 29/1450 2026-04-10 16:20 by 高维春
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 085404,285分求调剂 +12 薇薇考研 2026-04-07 14/700 2026-04-09 23:10 by parmtree
[考研] 284求调剂 +7 让我上岸吧阿西 2026-04-09 7/350 2026-04-09 18:59 by haironglove
[考研] 332,085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
[考研] 308求调剂 +17 墨墨漠 2026-04-06 17/850 2026-04-09 09:25 by 壹往無前
[考研] 求调剂 +15 熊二想上岸 2026-04-06 15/750 2026-04-08 04:53 by 无际的草原
信息提示
请填处理意见