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华西Aspirin

新虫 (初入文坛)

[交流] 双酶切分子克隆的分子过程 已有7人参与

引物上含酶切序列,但是PCR产物不是有一部分只含有一条合成的引物吗?这样不是只有其中一条链含有一种酶切序列?怎么双酶切法。。我的分子生物学方面学的很差不是很理解。印象中双酶切是两种酶同时切割目的片段和载体,按照PCR过程有一条模板链一条合成链,只有合成链才有引物才有酶切序列呀,虽然会有一部分合成链会成为模板,但还是有很多pcr产物是一条模板链一条合成链的吧
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010308Jing

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
正向引物引入一个酶切位点,反向引物引入另外一个酶切位点,正好就是双酶切了

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4楼2016-09-17 12:52:08
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010308Jing

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
只有一个酶切位点的产物你做酶连后是转化不出克隆的,不用担心这个问题

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7楼2016-09-18 05:31:44
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迷路人啊

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你说的这种情况只是第一个循环的产物   后面循环就是带有双酶切位点的dna了

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13楼2016-09-22 16:20:48
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普通回帖

juzhixianwei

铜虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-09-17 06:44:59
因为起始的模板量很低,所以PCR产物主要还是合成链,合成链是双链DNA,两头分别是两段引物,所以含有引物上的酶切序列

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2楼2016-09-16 16:51:47
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DAX1

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xn8008: 欢迎发帖交流 2016-09-17 06:45:05
汗,真给这个问题给问道了,不知道怎么解释才好。内切酶是切双链,然后PCR产物也是双链啊,我们一般用的会识别回文结构二类酶

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2016-09-16 16:52:10
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luckydog52

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Pcr原理有待提高啊

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自信源于一次次成功的积累
5楼2016-09-17 21:24:44
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华西Aspirin

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 010308Jing at 2016-09-17 12:52:08
正向引物引入一个酶切位点,反向引物引入另外一个酶切位点,正好就是双酶切了

我意思是,根据半保留复制, pcr完成后,产物不是会有一部分DNA,其双链中有一条我们加的模板(上面没有引物),另一条是带有我们合成的引物的合成链吗?这样这部分产物不就只有一个酶切位点了吗

发自小木虫Android客户端
6楼2016-09-17 22:12:49
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didongwei

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
所谓的内切酶酶切,切的是回文序列,也就是反向互补的双链。而PCR扩增是半保留复制,换言之也就是PCR扩增是以原始DNA的两条链分别为模板进行复制,一条双链复制成两条双链,所以在PCR反应体系中存在的绝大多数是双链DNA,而酶切要在PCR结束时进行,此时体系中几乎都是双链DNA,所以,你所谓的问题事实上是一种误解,不知道我解释清楚没?如有不懂,可以继续追问,祝好
不是优秀,而是不可替代
8楼2016-09-18 08:31:43
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yuy111

银虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
good luck for all the confusions, welcome new biologist.
9楼2016-09-21 05:16:34
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华西Aspirin

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by didongwei at 2016-09-18 08:31:43
所谓的内切酶酶切,切的是回文序列,也就是反向互补的双链。而PCR扩增是半保留复制,换言之也就是PCR扩增是以原始DNA的两条链分别为模板进行复制,一条双链复制成两条双链,所以在PCR反应体系中存在的绝大多数是双链 ...

謝謝,不過我的問題在於雙酶切,載體上有兩個切口,那我的目的基因也應該是兩個一樣的切口,然後正向引物和反向引物各有一個酶切位點。那麼理想的情況是正向和反向引物所在的單鏈組成雙鏈,可是我們加入的模板是沒有引物的呀,也我意思就是pcr合成的DNA雙鏈中,其中一种為正向引物結合在5'→3'模板鏈,另一種是反向引物結合在3'→5'模板鏈合成的,這樣新合成的DNA就只含有正向引物或只含有反向引物,也就是只含有一個酶切位點

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10楼2016-09-22 14:44:29
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