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Alpha s新虫 (小有名气)
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用MPICH3.2, BLACS,LAPACK.SCALAPACK安装siesta 已有1人参与
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我用MPICH3.2, BLACS,LAPACK.SCALAPACK这几个数学库来安装siesta，能够顺利的编译过，但是在运行的时候会报错。比如是在用范德瓦尔斯势来计算单个原子的时候就会报错，MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD with errorcode 1. NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes. You may or may not see output from other processes, depending on exactly when Open MPI kills them. 这整个编译过程中都没有报错，我发现我改用openmpi的时候，也是一样的报错。请问高手如何解决呢。 |
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Alpha s
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3楼2016-08-11 15:04:14
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流 2016-08-12 15:28:14
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在生成的arch.make文件中新加入 DUMMY_FOX= --enable-dummy FFLAGS_DEBUG= -g -O2 而后在Obj文件夹中的makefile文件，将这几行写成如下形式 (FoXconfigured)  cdFoX;toucharch.make; CONFIGURE="(FoXconfigured)cdFoX;toucharch.make; CONFIGURE="(VPATH)/FoX/configure"; \$$CONFIGURE VPATH="$(VPATH)/FoX" \ FC="$(FC_SERIAL)" FCFLAGS="$(FFLAGS_DEBUG)" \ --enable-wcml $(DUMMY_FOX) || false ) 注意(cd FoX; touch arch.make ; \这一行前是一个Tab空格，而不是一个space空格 将这两个地方修改好后， make clen make |
5楼2016-08-12 15:17:26
Alpha s
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6楼2016-08-12 16:43:00
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