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autodock数据处理 已有2人参与
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对接成功了，但是数据处理时出现一堆错误提示，重做了好几次，都是这里出问题，求帮助，谢谢大家了！  发自小木虫Android客户端 |
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4楼2016-08-04 16:58:01
qyj2006
铁杆木虫 (小有名气)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 9014.8
- 红花: 2
- 帖子: 224
- 在线: 76.5小时
- 虫号: 181781
- 注册: 2006-02-11
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
2楼2016-08-02 15:26:31
3楼2016-08-03 10:01:38
【答案】应助回帖
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你的问题解决了吗？我分析dlg文件时出现和你差不多的错误，但也有点不同 Python 2.5.6 (r256:88840, Nov 6 2012, 15:29:26) [GCC 4.1.2 20061115 (prerelease) (Debian 4.1.1-21)] on linux2 Type "copyright", "credits" or "license()" for more information. **************************************************************** Personal firewall software may warn about the connection IDLE makes to its subprocess using this computer's internal loopback interface. This connection is not visible on any external interface and no data is sent to or received from the Internet. **************************************************************** IDLE 1.2.6 ==== No Subprocess ==== >>> ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/ViewerFramework/VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/Pmv/displayCommands.py", line 643, in doit geomC = mol.geomContainer AttributeError: Protein instance has no attribute 'geomContainer' ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/ViewerFramework/VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/Pmv/colorCommands.py", line 508, in doit ColorCommand.doit(self, nodes, colors, geomsToColor) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/Pmv/colorCommands.py", line 122, in doit if not mol.geomContainer.geoms.has_key(gName): continue AttributeError: Protein instance has no attribute 'geomContainer' ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/ViewerFramework/VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/Pmv/colorCommands.py", line 122, in doit if not mol.geomContainer.geoms.has_key(gName): continue AttributeError: Protein instance has no attribute 'geomContainer' exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/ViewerFramework/VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/ViewerFramework/VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "/home/zhang8343120/autodock/mgltools/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' |
5楼2017-02-16 21:33:04