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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 求助Autodock insufficient grid points
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jinxiao1991

木虫 (小有名气)

[求助] 求助Autodock insufficient grid points 已有2人参与

Autodock 好难用啊！弄了好久才把之前的出错都解决了，到最后一步又出错了
我已经重做好多次了，实在没办法只能来求助。Autogrid过程应该是没有问题的，那个格子包住了受体和配体，其余都是按照教程做的。
我把terminal 和dlg文件都截图放上来了，希望有大神能够不吝指点。

求助Autodock insufficient grid points
terminal.png


求助Autodock insufficient grid points-1
dlg.png
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1楼 2016-07-09 14:25:54
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zhang360

新虫 (正式写手)
想问一下pts是什么单位
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2楼2016-07-10 00:35:02
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zhang360

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我已经把上面的问题解决了，不过弄了好久才解决
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3楼2016-07-10 09:07:49
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jinxiao1991

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhang360 at 2016-07-10 09:07:49
我已经把上面的问题解决了，不过弄了好久才解决

请问你是怎么解决的啊？

发自小木虫IOS客户端
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4楼2016-07-10 09:19:25
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
重新设置一下bos的空间位置及大小把，然后对接试试
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5楼2016-07-10 14:44:02
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jinxiao1991

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pymol at 2016-07-10 14:44:02
重新设置一下bos的空间位置及大小把，然后对接试试

多谢回复！
请问要怎么设置box呢？我设置了两次，一次是包住了整个受体和配体，还有一次包住了整个屏幕，结果都是一样的。

还有请问一下map type要怎么设置啊？
赞一下 回复此楼
6楼2016-07-11 23:40:09
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by jinxiao1991 at 2016-07-11 23:40:09
多谢回复！
请问要怎么设置box呢？我设置了两次，一次是包住了整个受体和配体，还有一次包住了整个屏幕，结果都是一样的。

还有请问一下map type要怎么设置啊？...

box位置要设置在活性位点处，如果有天然配体就参考天然配体
赞一下 回复此楼
7楼2016-07-19 16:15:06
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icecream1112

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhang360 at 2016-07-10 09:07:49
我已经把上面的问题解决了，不过弄了好久才解决

可否请教一下，我也遇到了同样问题，需要怎么解决呢？
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8楼2018-10-03 21:39:50
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