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lvyueguang

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白酶基因片段 质粒表达 提取蛋白 已有3人参与

大家好,想问一下知道某一种酶的在PDB里面的ID(比如 3TS1),怎么找到它的基因序列,然后找公司导到质粒里面,最后在大肠杆菌里面表达蛋白、提取蛋白?麻烦说一下大概步骤~  第一次做生物...谢谢谢谢
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ls2046

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个写起来太多,得累死。为什么不自己看文献找方法呢,问题只有自己一步一步去发现,解决,才能真正掌握。简单一个提问,看起来自己太懒了啊
一品黄山
2楼2016-07-05 17:05:35
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lvyueguang: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-07-07 15:36:05
一般序列信息结构对应的文献里都能找到。但像你举的这个例子,文献比较老。可以先找蛋白序列,再通过blastp找到其在NCBI中的对应信息。方法:在PDB网站主页,搜索3TS1,在结果界面,点击右上display按钮,选择显示fasta格式序列,就可以显示其蛋白质序列。如下:>3TS1:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
MDLLAELQWRGLVNQTTDEDGLRKLLNEERVTLYCGFDPTADSLHIGHLATILTMRRFQQAGHRPIALVGGATGLIGDPS
GKKSERTLNAKETVEAWSARIKEQLGRFLDFEADGNPAKIKNNYDWIGPLDVITFLRDVGKHFSVNYMMAKESVQSRIET
GISFTEFSYMMLQAYDFLRLYETEGCRLQIGGSDQWGNITAGLELIRKTKGEARAFGLTIPLVTKADGTKFGKTESGTIW
LDKEKTSPYEFYQFWINTDDRDVIRYLKYFTFLSKEEIEALEQELREAPEKRAAQKTLAEEVTKLVHGEEALRQAIRISE
ALFSGDIANLTAAEIEQGFKDVPSFVHEGGDVPLVELLVSAGISPSKRQAREDIQNGAIYVNGERLQDVGAILTAEHRLE
GRFTVIRRGKKKYYLIRYA
经tblastn可知该段蛋白对应的NCBI中登录号:J01546
3楼2016-07-05 18:46:40
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以做蛋白表达纯化

发自小木虫Android客户端
4楼2016-07-06 08:11:22
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hc-material

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以看看《分子克隆指南》。祝顺利。
5楼2016-07-06 14:17:54
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ls2046 at 2016-07-05 17:05:35
这个写起来太多,得累死。为什么不自己看文献找方法呢,问题只有自己一步一步去发现,解决,才能真正掌握。简单一个提问,看起来自己太懒了啊

好的 谢谢
6楼2016-07-07 15:35:15
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2016-07-05 18:46:40
一般序列信息结构对应的文献里都能找到。但像你举的这个例子,文献比较老。可以先找蛋白序列,再通过blastp找到其在NCBI中的对应信息。方法:在PDB网站主页,搜索3TS1,在结果界面,点击右上display按钮,选择显示f ...

谢谢~~~
7楼2016-07-07 15:36:29
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by star013 at 2016-07-06 08:11:22
我们可以做蛋白表达纯化

谢谢
8楼2016-07-07 15:37:58
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by hc-material at 2016-07-06 14:17:54
可以看看《分子克隆指南》。祝顺利。

好的  谢谢
9楼2016-07-07 15:39:32
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送红花一朵
10楼2016-07-12 17:42:03
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