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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 蛋白酶基因片段 质粒表达 提取蛋白
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白酶基因片段 质粒表达 提取蛋白 已有3人参与

大家好，想问一下知道某一种酶的在PDB里面的ID（比如 3TS1），怎么找到它的基因序列，然后找公司导到质粒里面，最后在大肠杆菌里面表达蛋白、提取蛋白？麻烦说一下大概步骤~  第一次做生物...谢谢谢谢
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1楼 2016-07-05 16:57:03
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ls2046

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个写起来太多，得累死。为什么不自己看文献找方法呢，问题只有自己一步一步去发现，解决，才能真正掌握。简单一个提问，看起来自己太懒了啊
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一品黄山
2楼2016-07-05 17:05:35
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lvyueguang: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-07-07 15:36:05
一般序列信息结构对应的文献里都能找到。但像你举的这个例子，文献比较老。可以先找蛋白序列，再通过blastp找到其在NCBI中的对应信息。方法：在PDB网站主页，搜索3TS1，在结果界面，点击右上display按钮，选择显示fasta格式序列，就可以显示其蛋白质序列。如下：>3TS1:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
MDLLAELQWRGLVNQTTDEDGLRKLLNEERVTLYCGFDPTADSLHIGHLATILTMRRFQQAGHRPIALVGGATGLIGDPS
GKKSERTLNAKETVEAWSARIKEQLGRFLDFEADGNPAKIKNNYDWIGPLDVITFLRDVGKHFSVNYMMAKESVQSRIET
GISFTEFSYMMLQAYDFLRLYETEGCRLQIGGSDQWGNITAGLELIRKTKGEARAFGLTIPLVTKADGTKFGKTESGTIW
LDKEKTSPYEFYQFWINTDDRDVIRYLKYFTFLSKEEIEALEQELREAPEKRAAQKTLAEEVTKLVHGEEALRQAIRISE
ALFSGDIANLTAAEIEQGFKDVPSFVHEGGDVPLVELLVSAGISPSKRQAREDIQNGAIYVNGERLQDVGAILTAEHRLE
GRFTVIRRGKKKYYLIRYA
经tblastn可知该段蛋白对应的NCBI中登录号：J01546
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3楼2016-07-05 18:46:40
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star013

新虫 (知名作家)
我们可以做蛋白表达纯化

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4楼2016-07-06 08:11:22
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hc-material

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以看看《分子克隆指南》。祝顺利。
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5楼2016-07-06 14:17:54
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ls2046 at 2016-07-05 17:05:35
这个写起来太多，得累死。为什么不自己看文献找方法呢，问题只有自己一步一步去发现，解决，才能真正掌握。简单一个提问，看起来自己太懒了啊

好的 谢谢
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6楼2016-07-07 15:35:15
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2016-07-05 18:46:40
一般序列信息结构对应的文献里都能找到。但像你举的这个例子，文献比较老。可以先找蛋白序列，再通过blastp找到其在NCBI中的对应信息。方法：在PDB网站主页，搜索3TS1，在结果界面，点击右上display按钮，选择显示f ...

谢谢~~~
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7楼2016-07-07 15:36:29
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by star013 at 2016-07-06 08:11:22
我们可以做蛋白表达纯化

谢谢
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8楼2016-07-07 15:37:58
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lvyueguang

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hc-material at 2016-07-06 14:17:54
可以看看《分子克隆指南》。祝顺利。

好的  谢谢
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9楼2016-07-07 15:39:32
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13365332129
送红花一朵


发自小木虫IOS客户端
10楼2016-07-12 17:42:03
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