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yujifeierhwf

新虫 (初入文坛)

[求助] T-克隆构建质粒不成功 已有4人参与

求助给位大神
PCR扩增目的产物条带单一,回收后进行克隆连接,平板蓝白斑长的正常,但挑白斑进行菌液PCR验证时只有二聚体
验证用的引物是T7/SP6的质粒通用引物。
用T-克隆试剂盒中的核酸进行克隆连接,并检测白菌落,有目的产物是对的。就是说感受态细胞和载体是正常的,根据这个结果重新获取PCR产物,但结果仍然是菌落正常,菌液验证就是没有条带,连空载的片段都没有
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努力成为专业人士
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xiedaim

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。myprayer祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-07 23:18:10
前几天看到一个关于PCR实验资料问答的网站,http://www.ebioq.com/openlab/12/0,推荐你看看,我们实验室当时做不好就在这做了,还蛮好,你看看。
2楼2016-06-07 16:38:48
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啦啦啦chen

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。myprayer祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-07 23:18:21
你回收的PCR条带测序了吗?建议测序一下看看是否有目的条带
3楼2016-06-07 17:19:16
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。myprayer祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-07 23:18:31
可以从以下几方面找原因,第一,确认一下使用的聚合酶是否具有末端加A的功能,如果没有,你需要对pcr产物进行加A。第二,回收的pcr产物最好进行电泳检测,确保片段回收成功,并且可以根据其浓度调整连接体系。第三,挑取克隆进行pcr的时候,可以找个已经构建成功的质粒作为阳性对照,确保pcr体系没有问题,同时可以用片段特异性引物来辅助验证。最后,可以不进行菌液pcr或者不管菌液pcr结果如何,对挑取的克隆提质粒,对质粒进行酶切和pcr验证,这应该是最可靠的方法,因为经常会出现菌液pcr没有结果,但是酶切验证是正确的现象,所以个人觉得酶切验证及测序分析应该是判断克隆是否构建成功的依据,菌液pcr只是初筛,容易出现误差。

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
4楼2016-06-07 17:43:40
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暗星

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
将你的回收产物跑一下胶,看看是否有回收产物。如果有回收产物,估算一下你的回收产物的浓度,然后按照大致回收产物:载体=3:1的比例进行连接反应(如果时间充裕可以考虑过夜连接)
我一般是在4度连接过夜,效果还是可以的。(用的是pmd18&19)
5楼2016-06-07 17:44:10
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