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花落已季末

银虫 (小有名气)

[求助] 质粒切不开 已有4人参与

内切酶用的XbaI,位于我的目的基因两边,测序结果表明酶切位点序列正确,两边也没有甲基化位点,想用XbaI进行酶切,但调整质粒浓度,酶量,反应体系,酶切时间,更换新的内切酶,始终切不开,求教各位高手

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流年似水,看不透的是红尘中镜花水月;往事如烟,挥不去的是岁月荏苒一过往;待得繁华落尽,只余回忆。
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的基因是连在质粒载体上对吧,这两个xbai位点是质粒上的?还是你插入的目的基因上的?所谓的切开,是电泳显示把你目的基因切下来?不清楚你进行酶切的目的是做什么,如果是酶切验证克隆,可以更换其他酶来处理,只要能切出正确大小即可。如果是为了回收目的片段进行亚克隆,我不清楚为什么选择单酶切,当然实在切不下来,你可以通过pcr扩增来获得目的片段。对于你说的切不开,我猜测的原因:测序显示酶切位点正确,其实这个不应该是在你测序前就已经构建好正确的图谱了么,除非你的目的基因是未知序列,然后测序结果来和你的理论序列对比看是否正确,而且测序结果最好有平行的,一个测序结果通常说服力太小。另一个就是要你确定这个酶切位点是否被甲基化,,毕竟xbai还是非常容易被甲基化或者其他修饰的,可以参考这个酶的说明书,尽量在甲基化缺陷的感受态进行克隆,祝好!

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
7楼2016-05-31 07:35:21
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tfytli

金虫 (职业作家)

你用的哪个公司的酶?多大的体系?质粒及酶的用量是多少?这些细节要说清楚我们才好判断。这个酶我常用,没有切不开的情况,算是比较常用的酶。

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最令人信服的话莫过于一本正经的胡说八道,外加一点数据。
2楼2016-05-29 23:07:32
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花落已季末

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tfytli at 2016-05-29 23:07:32
你用的哪个公司的酶?多大的体系?质粒及酶的用量是多少?这些细节要说清楚我们才好判断。这个酶我常用,没有切不开的情况,算是比较常用的酶。

酶用过全式金的,也用过TAKARA的,体系是20ul,15ul质粒,2ul10╳buffer,3ul的酶

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3楼2016-05-30 07:52:44
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tfytli

金虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 花落已季末 at 2016-05-30 07:52:44
酶用过全式金的,也用过TAKARA的,体系是20ul,15ul质粒,2ul10╳buffer,3ul的酶
...

你用同样的酶量和质粒量,换50微升体系试试,切的时间尽量长一点。用的酶量不应超过体系的十分之一,会影响酶切效果。

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最令人信服的话莫过于一本正经的胡说八道,外加一点数据。
4楼2016-05-30 09:15:54
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lx910615

新虫 (小有名气)

我感觉有可能没有找到最佳条件

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5楼2016-05-31 07:17:23
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lx910615

新虫 (小有名气)

我好像用过80-100未的体系

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6楼2016-05-31 07:17:57
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小刺猬董董

铁虫 (初入文坛)

我感觉你体系中,质粒浓度太高了吧

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8楼2016-05-31 07:58:00
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花落已季末

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tfytli at 2016-05-30 09:15:54
你用同样的酶量和质粒量,换50微升体系试试,切的时间尽量长一点。用的酶量不应超过体系的十分之一,会影响酶切效果。
...

按照你说的试了试,依旧没有切开

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9楼2016-05-31 08:45:38
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tfytli

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
9楼: Originally posted by 花落已季末 at 2016-05-31 08:45:38
按照你说的试了试,依旧没有切开
...

那你只能用这个酶切其他带有这个位点的质粒看看,要是也切不开,说明酶有问题,要是切开了,说明这个质粒有问题

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最令人信服的话莫过于一本正经的胡说八道,外加一点数据。
10楼2016-05-31 09:11:29
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