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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 模拟600K降温到300KK的过程(NVT系综,降温速率10K/10ps)
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Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

[求助] 模拟600K降温到300KK的过程(NVT系综,降温速率10K/10ps) 已有2人参与

S. Yang(2012)的文章中为了使构型稳定，先将分子系统在600K(NVT)下运行1ns，然后需要降温到300K(降温速率10K/10ps)，请问大家，用哪个模块可以实现匀速降温呢？

具体文章中的语言是这样的：In the end, in order to achieve a fully relaxed network, the crosslinked system is further equilibrated by MD simulations under the canonical (NVT) ensemble at 600 K for 1 ns, followed by NVT annealing to 300 K at the cooling rate of 10 K/10 ps.

尝试了Forcite annealing，但是不符合要求，好不纠结~~

真心感谢！
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快乐的小逗比~
1楼 2016-05-28 15:47:34
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
就是Forcite模块，可以的，自己设置参数。注意这得分两步：1. 600K(NVT)下运行1ns；2. 降温到300K(降温速率10K/10ps)。为什么说不符合要求？
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2楼2016-05-28 16:39:32
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Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaowu759 at 2016-05-28 16:39:32
就是Forcite模块，可以的，自己设置参数。注意这得分两步：1. 600K(NVT)下运行1ns；2. 降温到300K(降温速率10K/10ps)。为什么说不符合要求？

请问是Forcite的哪一个功能呢？我之前尝试的是annealing，发现它是对称的先升温后降温，是不是我找错功能了？或者是设置错了？
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快乐的小逗比~
3楼2016-05-29 09:27:39
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ninitongtong

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这是用forecite模块dynamic功能，每次手动调整温度以及时间，比较繁琐！

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-05-30 10:49:50
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Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ninitongtong at 2016-05-30 10:49:50
这是用forecite模块dynamic功能，每次手动调整温度以及时间，比较繁琐！

我现在是用annealing的功能，先匀速降温后匀速升温，然后再进行下一步平衡的时候用的是中间的构型，您觉得这样可以吗？
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快乐的小逗比~
5楼2016-05-30 14:32:51
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ninitongtong

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Yolanda_syy at 2016-05-30 14:32:51
我现在是用annealing的功能，先匀速降温后匀速升温，然后再进行下一步平衡的时候用的是中间的构型，您觉得这样可以吗？...

不好意思，这个不是很清楚了

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6楼2016-05-30 23:32:05
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Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ninitongtong at 2016-05-30 23:32:05
不好意思，这个不是很清楚了
...

嗯，谢谢啦~
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快乐的小逗比~
7楼2016-05-31 15:44:36
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yeahhanpei

金虫 (正式写手)
楼主，你的这篇文章名字叫啥？我想看看，能否告知？谢谢啦
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我的梦想那么大，我却离得那么远！
8楼2016-11-07 11:23:48
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