24小时热门版块排行榜    

查看: 1850  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

[求助] 模拟600K降温到300KK的过程(NVT系综,降温速率10K/10ps) 已有2人参与

S. Yang(2012)的文章中为了使构型稳定,先将分子系统在600K(NVT)下运行1ns,然后需要降温到300K(降温速率10K/10ps),请问大家,用哪个模块可以实现匀速降温呢?

具体文章中的语言是这样的:In the end, in order to achieve a fully relaxed network, the crosslinked system is further equilibrated by MD simulations under the canonical (NVT) ensemble at 600 K for 1 ns, followed by NVT annealing to 300 K at the cooling rate of 10 K/10 ps.

尝试了Forcite annealing,但是不符合要求,好不纠结~~

真心感谢!
回复此楼
快乐的小逗比~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yeahhanpei

金虫 (正式写手)

楼主,你的这篇文章名字叫啥?我想看看,能否告知?谢谢啦
我的梦想那么大,我却离得那么远!
8楼2016-11-07 11:23:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
就是Forcite模块,可以的,自己设置参数。注意这得分两步:1. 600K(NVT)下运行1ns;2. 降温到300K(降温速率10K/10ps)。为什么说不符合要求?
2楼2016-05-28 16:39:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaowu759 at 2016-05-28 16:39:32
就是Forcite模块,可以的,自己设置参数。注意这得分两步:1. 600K(NVT)下运行1ns;2. 降温到300K(降温速率10K/10ps)。为什么说不符合要求?

请问是Forcite的哪一个功能呢?我之前尝试的是annealing,发现它是对称的先升温后降温,是不是我找错功能了?或者是设置错了?
快乐的小逗比~
3楼2016-05-29 09:27:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ninitongtong

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这是用forecite模块dynamic功能,每次手动调整温度以及时间,比较繁琐!

发自小木虫Android客户端
4楼2016-05-30 10:49:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+3 winsaint 2026-08-27 7/350 2026-08-28 07:06 by hejicker
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +7 苏东坡二世 2026-08-23 7/350 2026-08-27 18:14 by 瞬息宇宙
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见