24小时热门版块排行榜    

查看: 1491  |  回复: 7

Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

[求助] 模拟600K降温到300KK的过程(NVT系综,降温速率10K/10ps) 已有2人参与

S. Yang(2012)的文章中为了使构型稳定,先将分子系统在600K(NVT)下运行1ns,然后需要降温到300K(降温速率10K/10ps),请问大家,用哪个模块可以实现匀速降温呢?

具体文章中的语言是这样的:In the end, in order to achieve a fully relaxed network, the crosslinked system is further equilibrated by MD simulations under the canonical (NVT) ensemble at 600 K for 1 ns, followed by NVT annealing to 300 K at the cooling rate of 10 K/10 ps.

尝试了Forcite annealing,但是不符合要求,好不纠结~~

真心感谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

快乐的小逗比~
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
就是Forcite模块,可以的,自己设置参数。注意这得分两步:1. 600K(NVT)下运行1ns;2. 降温到300K(降温速率10K/10ps)。为什么说不符合要求?
2楼2016-05-28 16:39:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaowu759 at 2016-05-28 16:39:32
就是Forcite模块,可以的,自己设置参数。注意这得分两步:1. 600K(NVT)下运行1ns;2. 降温到300K(降温速率10K/10ps)。为什么说不符合要求?

请问是Forcite的哪一个功能呢?我之前尝试的是annealing,发现它是对称的先升温后降温,是不是我找错功能了?或者是设置错了?
快乐的小逗比~
3楼2016-05-29 09:27:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ninitongtong

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这是用forecite模块dynamic功能,每次手动调整温度以及时间,比较繁琐!

发自小木虫Android客户端
4楼2016-05-30 10:49:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ninitongtong at 2016-05-30 10:49:50
这是用forecite模块dynamic功能,每次手动调整温度以及时间,比较繁琐!

我现在是用annealing的功能,先匀速降温后匀速升温,然后再进行下一步平衡的时候用的是中间的构型,您觉得这样可以吗?
快乐的小逗比~
5楼2016-05-30 14:32:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ninitongtong

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Yolanda_syy at 2016-05-30 14:32:51
我现在是用annealing的功能,先匀速降温后匀速升温,然后再进行下一步平衡的时候用的是中间的构型,您觉得这样可以吗?...

不好意思,这个不是很清楚了

发自小木虫Android客户端
6楼2016-05-30 23:32:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yolanda_syy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ninitongtong at 2016-05-30 23:32:05
不好意思,这个不是很清楚了
...

嗯,谢谢啦~
快乐的小逗比~
7楼2016-05-31 15:44:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yeahhanpei

金虫 (正式写手)

楼主,你的这篇文章名字叫啥?我想看看,能否告知?谢谢啦
我的梦想那么大,我却离得那么远!
8楼2016-11-07 11:23:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Yolanda_syy 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 317求调剂 +12 申子申申 2026-03-19 18/900 2026-03-22 22:23 by luoyongfeng
[考研] 263求调剂 +4 yqdszhdap- 2026-03-22 4/200 2026-03-22 21:20 by 1144970272
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +11 枫桥ZL 2026-03-18 13/650 2026-03-22 20:26 by edmund7
[考研] 求调剂 +6 十三加油 2026-03-21 6/300 2026-03-22 17:00 by i_cooler
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-20 3/150 2026-03-22 16:00 by ColorlessPI
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 17/850 2026-03-22 15:18 by 脱颖而出
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 15/750 2026-03-21 13:24 by zhukairuo
[考研] 301求调剂 +10 yy要上岸呀 2026-03-17 10/500 2026-03-21 03:14 by JourneyLucky
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
请填处理意见