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[求助]
引物设计 已有4人参与
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本人现在正在做克隆实验，主要是克隆淀粉分支酶中一个同工酶基因的CDs区，以下是目的基因的mRNA，包含有目的基因的CDs区，其中mRNA全长为2780，CDs为7-2496，基因在NCBI登陆号为AF064561，是大麦的淀粉分支酶基因，我用了Oligo7和NCBI设计引物，但是得到的引物都没能够把CDs全全部包含进去，求助各位大侠帮助设计引物，在下感激不尽！谢谢！ 1 ggcgagatgg cggcgccggc gttcgcagtt tccgcggcgg ggatcgcccg gccatcggct 61 cgtcgatcca gcggggcaga gccgagatcg ctgctcttcg gccgcaacaa gggcacccgt 121 ttcccccgtg ccgtcggcgt cggaggttct gggtggcgcg tggtcatgcg cgcgggcggc 181 ccgtccgggg aggtgatgat ccctgacggc ggtagtggcg gaagcggaac accgccttcc 241 atcgagggtt ccgttcagtt cgagtctgat gatctggagg ttccattcat cgacgatgaa 301 ccaagcctgc acgatggagg tgaagatact attcggtctt cagagacata tcaggttact 361 gaagaaattg atgctgaagg cgtgagcaga atggacaaag aatcatccac ggtgaagaaa 421 atacgcattg tgccacaacc cggaaatgga cagcaaatat acgacattga cccaatgctc 481 cgagacttta agtaccatct tgagtatcga tacagcctat ataggagaat acgttcagac 541 attgatgaat acgatggagg catggatgta ttttcccgcg gctacgagaa gtttggattt 601 gttcgcagcg ctgaaggtat cacttaccga gaatgggctc ctggagcaga ttctgcagca 661 ttagttggcg acttcaacaa ttgggatcca actgcagacc atatgagcaa aaatgacttg 721 ggtatttggg agatttttct gccaaacaat gcagatggtt cgccgccaat tcctcatggc 781 tcacgggtga aggtgcggat ggatactcca tctgggacaa aggattcaat tcctgcttgg 841 atcaagtact ccgtgcagac tccaggagat ataccataca atggaatata ttatgaccct 901 cctgaagagg agaagtatgt attcaagcat cctcaaccta aacgaccaaa atcattgcgg 961 atatatgaaa cacatgttgg catgagtagc ccggaaccaa agatcaacac atatgcaaac 1021 ttcagagatg aggtgcttcc aagaattaaa agacttggat acaatgcagt tcaaataatg 1081 gcaatccaag agcattcata ctatggaagc tttgggtacc atgttaccaa tttctttgca 1141 ccaagtagcc gttttgggtc cccagaagat ttaaaatcct tgattgatag agctcacgag 1201 cttggtttgc ttgtcctgat ggatgttgtt cacagtcacg catcaagtaa taccttggac 1261 ggtttgaatg gttttgatgg cacggataca cattactttc atggcggctc acggggccat 1321 cactggatgt gggattctcg tgtgttcaac tacgggaata aggaagttat aaggtttcta 1381 ctttccaatg caagatggtg gctagaggaa tataagttcg atggtttccg attcgacggc 1441 gcgacctcca tgatgtatac ccaccatgga ttacaagtaa cctttacagg gagctaccat 1501 gaatattttg gctttgccac ggatgtagat gcagttgttt acttgatgct ggtgaatgat 1561 ctaattcacg cgctttatcc tgaagccgtt actattggtg aagatgttag tggaatgcct 1621 acatttgccc ttcctgttca agttggtggg gttggttttg actatcgctt acatatggcc 1681 gttgccgata aatggattga acttctcaaa ggaagcgatg aaggttggga gatgggtaat 1741 attgtgcaca cactaacaaa tagaaggtgg ttggaaaagt gtgttactta tgctgaaagt 1801 catgatcaag cacttgttgg agacaagact attgcattct ggttgatgga caaggatatg 1861 tatgatttca tggctctgaa cggaccttcg acacctaata ttgatcgcgg aatagcactg 1921 cataaaatga ttagacttat cacaatggct ttaggaggag agggttatct taactttatg 1981 ggaaatgagt tcgggcatcc tgaatggata gactttccaa gaggcccaca agtacttcca 2041 actggtaagt tcatcccagg aaataacaac agttacgaca aatgccgtcg aagatttgac 2101 ctgggtgatg cagaatttct caggtatcat ggtatgcagc aatttgatca ggcaatgcag 2161 catcttgagg aaaaatatgg ctttatgaca tcagaccacc agtacgtatc tcggaaacac 2221 gaggaagata aggtgatcgt gtttgaaaaa ggggacttgg tatttgtgtt caacttccac 2281 tggagtaata gctatttcga ctaccgggtc ggttgcttaa agcctgggaa gtacaaggtg 2341 gtgttagact cagacgctgg actctttggt ggatttggta ggatccatca cactggagag 2401 cacttcacta atggctgcca acatgacaac aggccccatt cgttctcagt gtacactcct 2461 agcagaacct gtgttgtcta tgctccaatg aactaacagc aaagtgcagc atgcgcatgc 2521 gcgctgttgt tgcttagtag caacataaat cgtatggtca atacaaccag gtgcaaggtt 2581 taataaggtt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttgcttca 2641 accagtcctg gatagacaag acaacatgat gttgtgctgt gtgctcccaa tccccagggc 2701 gttgtgagga aaacatgctc atctgtgtta ccattttatg aatcagcaac gatacttctc 2761 ccaaaaaaaa aaaaaaaaaa |
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用什么软件啊，我们都是直接序列上选的，只要符合引物的一些基本要求就可以了。pcr是很贱的。 发自小木虫Android客户端 |
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木小默12124楼2016-03-21 19:12:53
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