24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1731  |  回复: 33
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

木小默1212

金虫 (初入文坛)

[求助] 引物设计 已有4人参与

本人现在正在做克隆实验,主要是克隆淀粉分支酶中一个同工酶基因的CDs区,以下是目的基因的mRNA,包含有目的基因的CDs区,其中mRNA全长为2780,CDs为7-2496,基因在NCBI登陆号为AF064561,是大麦的淀粉分支酶基因,我用了Oligo7和NCBI设计引物,但是得到的引物都没能够把CDs全全部包含进去,求助各位大侠帮助设计引物,在下感激不尽!谢谢!

1 ggcgagatgg cggcgccggc gttcgcagtt tccgcggcgg ggatcgcccg gccatcggct
       61 cgtcgatcca gcggggcaga gccgagatcg ctgctcttcg gccgcaacaa gggcacccgt
      121 ttcccccgtg ccgtcggcgt cggaggttct gggtggcgcg tggtcatgcg cgcgggcggc
      181 ccgtccgggg aggtgatgat ccctgacggc ggtagtggcg gaagcggaac accgccttcc
      241 atcgagggtt ccgttcagtt cgagtctgat gatctggagg ttccattcat cgacgatgaa
      301 ccaagcctgc acgatggagg tgaagatact attcggtctt cagagacata tcaggttact
      361 gaagaaattg atgctgaagg cgtgagcaga atggacaaag aatcatccac ggtgaagaaa
      421 atacgcattg tgccacaacc cggaaatgga cagcaaatat acgacattga cccaatgctc
      481 cgagacttta agtaccatct tgagtatcga tacagcctat ataggagaat acgttcagac
      541 attgatgaat acgatggagg catggatgta ttttcccgcg gctacgagaa gtttggattt
      601 gttcgcagcg ctgaaggtat cacttaccga gaatgggctc ctggagcaga ttctgcagca
      661 ttagttggcg acttcaacaa ttgggatcca actgcagacc atatgagcaa aaatgacttg
      721 ggtatttggg agatttttct gccaaacaat gcagatggtt cgccgccaat tcctcatggc
      781 tcacgggtga aggtgcggat ggatactcca tctgggacaa aggattcaat tcctgcttgg
      841 atcaagtact ccgtgcagac tccaggagat ataccataca atggaatata ttatgaccct
      901 cctgaagagg agaagtatgt attcaagcat cctcaaccta aacgaccaaa atcattgcgg
      961 atatatgaaa cacatgttgg catgagtagc ccggaaccaa agatcaacac atatgcaaac
     1021 ttcagagatg aggtgcttcc aagaattaaa agacttggat acaatgcagt tcaaataatg
     1081 gcaatccaag agcattcata ctatggaagc tttgggtacc atgttaccaa tttctttgca
     1141 ccaagtagcc gttttgggtc cccagaagat ttaaaatcct tgattgatag agctcacgag
     1201 cttggtttgc ttgtcctgat ggatgttgtt cacagtcacg catcaagtaa taccttggac
     1261 ggtttgaatg gttttgatgg cacggataca cattactttc atggcggctc acggggccat
     1321 cactggatgt gggattctcg tgtgttcaac tacgggaata aggaagttat aaggtttcta
     1381 ctttccaatg caagatggtg gctagaggaa tataagttcg atggtttccg attcgacggc
     1441 gcgacctcca tgatgtatac ccaccatgga ttacaagtaa cctttacagg gagctaccat
     1501 gaatattttg gctttgccac ggatgtagat gcagttgttt acttgatgct ggtgaatgat
     1561 ctaattcacg cgctttatcc tgaagccgtt actattggtg aagatgttag tggaatgcct
     1621 acatttgccc ttcctgttca agttggtggg gttggttttg actatcgctt acatatggcc
     1681 gttgccgata aatggattga acttctcaaa ggaagcgatg aaggttggga gatgggtaat
     1741 attgtgcaca cactaacaaa tagaaggtgg ttggaaaagt gtgttactta tgctgaaagt
     1801 catgatcaag cacttgttgg agacaagact attgcattct ggttgatgga caaggatatg
     1861 tatgatttca tggctctgaa cggaccttcg acacctaata ttgatcgcgg aatagcactg
     1921 cataaaatga ttagacttat cacaatggct ttaggaggag agggttatct taactttatg
     1981 ggaaatgagt tcgggcatcc tgaatggata gactttccaa gaggcccaca agtacttcca
     2041 actggtaagt tcatcccagg aaataacaac agttacgaca aatgccgtcg aagatttgac
     2101 ctgggtgatg cagaatttct caggtatcat ggtatgcagc aatttgatca ggcaatgcag
     2161 catcttgagg aaaaatatgg ctttatgaca tcagaccacc agtacgtatc tcggaaacac
     2221 gaggaagata aggtgatcgt gtttgaaaaa ggggacttgg tatttgtgtt caacttccac
     2281 tggagtaata gctatttcga ctaccgggtc ggttgcttaa agcctgggaa gtacaaggtg
     2341 gtgttagact cagacgctgg actctttggt ggatttggta ggatccatca cactggagag
     2401 cacttcacta atggctgcca acatgacaac aggccccatt cgttctcagt gtacactcct
     2461 agcagaacct gtgttgtcta tgctccaatg aactaacagc aaagtgcagc atgcgcatgc
     2521 gcgctgttgt tgcttagtag caacataaat cgtatggtca atacaaccag gtgcaaggtt
     2581 taataaggtt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttttgcttca
     2641 accagtcctg gatagacaag acaacatgat gttgtgctgt gtgctcccaa tccccagggc
     2701 gttgtgagga aaacatgctc atctgtgtta ccattttatg aatcagcaac gatacttctc
     2761 ccaaaaaaaa aaaaaaaaaa
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木小默1212

金虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by Bioexperixgs at 2016-03-21 19:12:53
用什么软件啊,我们都是直接序列上选的,只要符合引物的一些基本要求就可以了。pcr是很贱的。

用了Primer5,Oligo7和NCBI,但都没找到符合要求的引物!怎么直接在序列上选择呢,能否细说一下,谢谢!
8楼2016-03-21 19:32:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 34 个回答

yvonne9044

新虫 (正式写手)

这两个我没用过,你你把范围选到你的目的片段之外不行么

发自小木虫Android客户端
2楼2016-03-21 17:30:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

施子墨

金虫 (正式写手)

你要是扩增整个CDS区,你手动设计不就好了~

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-03-21 18:02:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Bioexperixgs

新虫 (正式写手)

用什么软件啊,我们都是直接序列上选的,只要符合引物的一些基本要求就可以了。pcr是很贱的。

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2016-03-21 19:12:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 学硕288调剂!!! +3 小王xw123 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:20 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +13 hanamiko 2026-04-01 13/650 2026-04-03 18:30 by ls刘帅
[考研] 五邑大学土木工程招调剂生2026 +3 wyutj 2026-03-31 4/200 2026-04-03 18:21 by zengxj_7201
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-03 16:46 by wxiongid
[考研] 0705理学294求调剂 +3 成果成果cg5 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:04 by simons1972
[考研] 316求调剂 +14 舟自梗 2026-04-01 18/900 2026-04-03 10:28 by linyelide
[考研] 交通运输考试264分求工科调剂 +4 jike777 2026-04-02 4/200 2026-04-02 21:53 by zllcz
[考研] 085602化工求调剂(331分) +9 111@127 2026-03-30 9/450 2026-04-02 20:00 by dick_runner
[考研] +4 雾与海 2026-04-02 5/250 2026-04-02 19:16 by 土木硕士招生
[考研] 求调剂求调剂 +7 121. 2026-04-02 7/350 2026-04-02 19:15 by dick_runner
[考研] 286分调剂 +20 Faune 2026-03-30 22/1100 2026-04-02 13:24 by clyblh
[考研] 材料工程322分 +8 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 8/400 2026-04-02 11:53 by 3041
[考研] 311求调剂 +10 李芷新1 2026-03-31 10/500 2026-04-01 14:38 by chenqifeng666
[考研] 283求调剂 +9 A child 2026-03-28 9/450 2026-04-01 14:20 by Jaylen.
[考研] 322求调剂 +8 三水sss 2026-04-01 8/400 2026-04-01 10:19 by 唐沐儿
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 考研调剂 +9 小蜡新笔 2026-03-29 10/500 2026-03-31 19:52 by Dyhoer
[考研] 求化学调剂 +12 wulanna 2026-03-28 12/600 2026-03-31 16:38 by 690616278
[考研] 生物考研337分求调剂 +4 cgxin 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:18 by 记事本2026
[考研] 297 地理学070500 复试求调剂 +3 小圆圈圈ooo 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:05 by 余震yz
信息提示
请填处理意见