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redking2012

木虫 (正式写手)

[交流] ssDNA的纯化问题

最近在纯化单链DNA,大概长5k,用qiagen的dna纯化试剂盒纯化之后,得到的产物量相当低。貌似qiagen的试剂盒是专门为双链DNA设计的。请问大家有没有单链DNA的纯化方法或者试剂盒

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redking2012

木虫 (正式写手)

3楼2016-02-28 04:48:48
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oliviashane

新虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
redking2012: 金币+5, 有用有帮助 2016-02-28 18:02:30
QIAquick PCR产物纯化试剂盒(Qiagen)是可直接纯化扩增后的双或单链PCR产物(100 bp-10 kb),最多纯化得到10微克DNA,达到90-95%的回收率。你的回收率低是有很多原因的,比(1)切入多余凝胶使纯化时琼脂糖凝胶未完全融化。对此建议尽量切掉不含DNA的琼脂糖凝胶,离心纯化柱内最大不要超过400mg琼脂糖凝胶,或者增加温育时间至15分钟,每2分钟混匀一次。(2)制备的琼脂糖凝胶浓度过高。对此建议配制0.8%~1.0%的琼脂糖凝胶进行回收。(3)有乙醇或异丙醇残留,建议增加离心时间或增加静置时间,使乙醇或异丙醇挥发完全。(4)洗脱温度过低或洗脱时间过短。建议在加入无菌超纯水或10 mM Tris·Cl(pH 8.5)后,于37℃温育2分钟。
4楼2016-02-28 13:35:21
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pennchem

专家顾问 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
redking2012: 金币+3, 有用 2016-02-28 18:03:16
Qiagen有专门纯化单链DNA (M13)的试剂盒
行至水穷处,坐看云起时
5楼2016-02-28 14:47:58
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redking2012

木虫 (正式写手)

8楼2016-03-01 16:02:36
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