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dataideng

银虫 (初入文坛)

[交流] 有人从genomic DNA里PCR过大于8kb的长片段吗?已有7人参与

最近需要从genomic DNA里PCR一段8kb的片段,用的kit是Roche  Expand™ Long Template PCR System。引物长度~21bp,退火温度比Tm低2度。其余都是按protocol设置的。但是一直没有P出来。
有人有这种从基因组PCR长片段的经验吗?感谢分享和交流。
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dataideng

银虫 (初入文坛)

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2楼: Originally posted by fjtony163 at 2016-01-28 00:38:46
我们一般是做3到4kb 考虑把初始变性时间延长到七分钟以上

但是说明书写2分钟,不敢乱改啊

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8楼2016-01-29 22:45:39
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dataideng

银虫 (初入文坛)

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4楼: Originally posted by zhangyunjing at 2016-01-28 12:19:37
8 kb用长片段扩增试剂盒很容易就扩出来了,引物设计长一些,在25-30 bp左右,Tm设置在65℃,用生工的产品编号为 B639285的Long and Accurate PCR Kit,扩增过15 kb,扩增条带挺亮的

你的DNA是从血液里提的?

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9楼2016-01-29 22:46:22
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dataideng

银虫 (初入文坛)

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6楼: Originally posted by 游侠892 at 2016-01-29 09:08:13
我们实验室用诺维赞的酶可以在多倍体基因组中扩出8kb左右的片段,扩增速度~4kb/min。你可以试试。而且这个酶也不贵

请问你的基因组是怎么准备的?PCR产物跑胶回收?

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10楼2016-01-29 22:47:25
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dataideng

银虫 (初入文坛)

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3楼: Originally posted by sloop112 at 2016-01-28 09:44:35
长片段的基因克隆能够成功构建受限于多种因素,建议LZ用合成重组的方式,提高成功率

PCR之后要测序,所以最好一次出。

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11楼2016-01-29 22:48:10
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