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wenhuoyeying

新虫 (正式写手)

[求助] PCR扩增后,空白组有条带,是怎么回事? 已有1人参与

用的8F,1492R引物,扩增鱼类肠道内含物的DNA,PCR扩增后,空白组有条带,鲭鱼组没有条带,,是怎么回事?求高手分析

PCR扩增后,空白组有条带,是怎么回事?
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匿名

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西门吹雪170: 金币+2 2016-01-20 23:09:19
本帖仅楼主可见
2楼2016-01-20 14:02:18
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lifechuteng

新虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-20 23:09:39
我感觉PCR也没有那么灵敏,如果空白组污染了扩增出了条带,那为什么鲭鱼组没有污染呢?
会不会是您不小心放反了,我感觉还是比较有可能的。
3楼2016-01-20 16:52:12
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wenhuoyeying

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lifechuteng at 2016-01-20 16:52:12
我感觉PCR也没有那么灵敏,如果空白组污染了扩增出了条带,那为什么鲭鱼组没有污染呢?
会不会是您不小心放反了,我感觉还是比较有可能的。

你说这个情况我考虑过,但是实验时候我确认没放反,电泳时候做了两边一直都是这个结果。鲭鱼组没有污染,这个我也很困惑,想不通~~
4楼2016-01-20 20:05:39
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wenhuoyeying

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by becklittle at 2016-01-20 14:02:18
空白有条带有两种可能,一是引物设计不合理导致自身模版扩增,不过这种情况很少而且根据设计的大小跑胶能鉴定是不是。第二最常见情况就是污染了,分子生物学的污染要比细胞学污染更难处理,东西全扔了换新的,枪台面 ...

请问你说的“根据设计的大小跑胶能鉴定是不是”这个具体要怎么设计?另外,如果是空气污染的话,应该怎么办?当然枪头,台面什么的下次会注意的。
5楼2016-01-20 20:07:43
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匿名

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感谢参与,应助指数 +1
wenhuoyeying: 金币+10 2016-01-26 13:29:22
wenhuoyeying: 金币+10 2016-04-05 09:24:27
本帖仅楼主可见
6楼2016-01-20 20:25:26
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joeming123

银虫 (小有名气)

我也遇到同样的事了。
前天做PCR  NTC没有条带,昨天按照一样的方法,NTC也有很亮的条带。
不知道是什么污染了,今天准备换个实验室,试试。  不知道会不会有所改善!
真是捉急, 都开始怀疑是自己把试剂污染了!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

现在的路越来越难走
7楼2016-01-21 09:04:06
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wenhuoyeying

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by joeming123 at 2016-01-21 09:04:06
我也遇到同样的事了。
前天做PCR  NTC没有条带,昨天按照一样的方法,NTC也有很亮的条带。
不知道是什么污染了,今天准备换个实验室,试试。  不知道会不会有所改善!
真是捉急, 都开始怀疑是自己把试剂污染了 ...

你做出来后,结果跟我说下吧,我们交流下~~
8楼2016-01-22 13:13:52
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joeming123

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by wenhuoyeying at 2016-01-22 13:13:52
你做出来后,结果跟我说下吧,我们交流下~~...

我换了实验室做,NTC还是有亮带。  后来我把整个PCR的试剂都换了,NTC就没有亮带了。
      PCR 的NTC有亮带,主要有两个原因,
1、实验室污染比较严重。  我的解决方案是:用10%的次氯酸钠擦拭桌面,板子和枪都擦一下,然后用紫外灯照半个小时。  第二天早上先用蒸馏水擦拭,最后在用酒精擦拭一遍。
2. 试剂污染。  除了样品以外,把整个实验室用到的试剂都换了。
现在的路越来越难走
9楼2016-01-22 16:22:31
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