24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1018  |  回复: 7
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 ycheng1 的 2 个金币

ycheng1

银虫 (正式写手)

[交流] 游离水加氢

请教各位高手游离水怎样加氢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手


ycheng1(金币+1,VIP+0):谢谢你的建议
有几种办法:
(1)根据差值Frouier Map中残留峰的大小来定,然后加入合理的限制精修。
  (2) 如果根据差值中残留峰找找不到氢的位置,可以用Wingx中的Cal-OH来计算游离水的合理位置,然后把计算出来的氢的坐标投入到ins文件中,并加入Afix指令进行精修。
  (3) 如果上面两种办法都不行,也可以不加氢,在文章中给以适当的说明即可;此外,用Platon中的Squeeze功能去掉溶剂水对整个结构精修的贡献。最后再根据计算结果把所缺少的电子个数加入到cif文件中(Fooo),相应把分子式、分子量都要做相应的改变, 文章中精修部分也要给以适当的说明。
新手学习
2楼2008-10-04 08:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengxinming

铁杆木虫 (职业作家)

嘻嘻哈哈家族创始人

我来学习一下
我费劲千辛爬上梯子的顶端,却发现梯子搭错了墙头……
3楼2008-10-04 09:22:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ycheng1

银虫 (正式写手)

游离水有氢键的取向问题,差值Frouier Map中残留峰的大小来定解决不了这个问题啊
4楼2008-10-04 09:26:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手

是的,氢键取向是很重要的一个标准。所以要-边精修一边观察氢键的情况。对于水分子,原则是每一个氢原子的方向都要有氢键.
新手学习
5楼2008-10-04 16:18:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)

mengxianggao 看来是高手.
能否详细说明一下squeez的用法, 最好举个例子.
让大家学习一下?
xi2004-emuch@163.com
6楼2008-10-04 16:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手

★ ★
ycheng1(金币+2,VIP+0):谢谢你发给你文章
最近Yaghi的一篇文章中说的比较详细,我已经放在论坛中了.为了下载方便,我重新放在网盘中,大家自己下。多读肯定有好处。文件名称:Yaghi JACS.pdf
http://www.namipan.com/d/90a1ce0 ... 8bbbedba18906921900
新手学习
7楼2008-10-04 19:00:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)

学习了,谢谢.
xi2004-emuch@163.com
8楼2008-10-04 22:07:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ycheng1 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 3/150 2026-04-19 21:44 by 淡雅人生27
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +7 喽哈加油 2026-04-13 8/400 2026-04-19 20:21 by Equinoxhua
[考研] 297,工科调剂? +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-19 20:07 by Equinoxhua
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 291求调剂 +11 关忆北. 2026-04-14 11/550 2026-04-19 17:16 by 中豫男
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考博] 申博/考博 +3 啃面包的小书虫 2026-04-17 4/200 2026-04-17 23:54 by 阳阳阳^_^
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
信息提示
请填处理意见