24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1019  |  回复: 7
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 ycheng1 的 2 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ycheng1

银虫 (正式写手)

[交流] 游离水加氢

请教各位高手游离水怎样加氢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ycheng1

银虫 (正式写手)

游离水有氢键的取向问题,差值Frouier Map中残留峰的大小来定解决不了这个问题啊
4楼2008-10-04 09:26:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手


ycheng1(金币+1,VIP+0):谢谢你的建议
有几种办法:
(1)根据差值Frouier Map中残留峰的大小来定,然后加入合理的限制精修。
  (2) 如果根据差值中残留峰找找不到氢的位置,可以用Wingx中的Cal-OH来计算游离水的合理位置,然后把计算出来的氢的坐标投入到ins文件中,并加入Afix指令进行精修。
  (3) 如果上面两种办法都不行,也可以不加氢,在文章中给以适当的说明即可;此外,用Platon中的Squeeze功能去掉溶剂水对整个结构精修的贡献。最后再根据计算结果把所缺少的电子个数加入到cif文件中(Fooo),相应把分子式、分子量都要做相应的改变, 文章中精修部分也要给以适当的说明。
新手学习
2楼2008-10-04 08:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手

是的,氢键取向是很重要的一个标准。所以要-边精修一边观察氢键的情况。对于水分子,原则是每一个氢原子的方向都要有氢键.
新手学习
5楼2008-10-04 16:18:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)

mengxianggao 看来是高手.
能否详细说明一下squeez的用法, 最好举个例子.
让大家学习一下?
xi2004-emuch@163.com
6楼2008-10-04 16:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 通信工程求调剂!!! +7 zlb770521 2026-04-14 7/350 2026-04-19 20:56 by Equinoxhua
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +7 喽哈加油 2026-04-13 8/400 2026-04-19 20:21 by Equinoxhua
[考研] 求调剂推荐 +9 小聂爱学习 2026-04-14 9/450 2026-04-19 17:03 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 291求调剂 +12 关忆北. 2026-04-14 13/650 2026-04-19 16:50 by 中豫男
[考研] 327求调剂 +27 Xxjc1107. 2026-04-13 30/1500 2026-04-19 08:22 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
信息提示
请填处理意见