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ycheng1

银虫 (正式写手)

[交流] 游离水加氢

请教各位高手游离水怎样加氢
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1楼 2008-10-04 00:21:19
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mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手
★
ycheng1(金币+1,VIP+0):谢谢你的建议
有几种办法：
（1）根据差值Frouier Map中残留峰的大小来定，然后加入合理的限制精修。
  (2) 如果根据差值中残留峰找找不到氢的位置，可以用Wingx中的Cal-OH来计算游离水的合理位置，然后把计算出来的氢的坐标投入到ins文件中，并加入Afix指令进行精修。
  (3) 如果上面两种办法都不行，也可以不加氢，在文章中给以适当的说明即可；此外，用Platon中的Squeeze功能去掉溶剂水对整个结构精修的贡献。最后再根据计算结果把所缺少的电子个数加入到cif文件中(Fooo)，相应把分子式、分子量都要做相应的改变, 文章中精修部分也要给以适当的说明。
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新手学习
2楼2008-10-04 08:12:22
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fengxinming

铁杆木虫 (职业作家)

嘻嘻哈哈家族创始人
我来学习一下
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我费劲千辛爬上梯子的顶端，却发现梯子搭错了墙头……
3楼2008-10-04 09:22:51
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ycheng1

银虫 (正式写手)
游离水有氢键的取向问题,差值Frouier Map中残留峰的大小来定解决不了这个问题啊
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4楼2008-10-04 09:26:55
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mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手
是的,氢键取向是很重要的一个标准。所以要－边精修一边观察氢键的情况。对于水分子，原则是每一个氢原子的方向都要有氢键.
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新手学习
5楼2008-10-04 16:18:05
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
mengxianggao 看来是高手.
能否详细说明一下squeez的用法, 最好举个例子.
让大家学习一下?
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xi2004-emuch@163.com
6楼2008-10-04 16:49:43
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mengxianggao

木虫 (正式写手)

新手
★ ★
ycheng1(金币+2,VIP+0):谢谢你发给你文章
最近Yaghi的一篇文章中说的比较详细,我已经放在论坛中了.为了下载方便，我重新放在网盘中，大家自己下。多读肯定有好处。文件名称：Yaghi JACS.pdf
http://www.namipan.com/d/90a1ce0 ... 8bbbedba18906921900
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新手学习
7楼2008-10-04 19:00:24
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
学习了,谢谢.
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xi2004-emuch@163.com
8楼2008-10-04 22:07:36
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