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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 对接中小分子的处理
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阿狸1205

捐助贵宾 (小有名气)

[交流] 对接中小分子的处理 已有2人参与

自己画的小分子结构应该怎么优化，用什么软件优化比较好

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1楼 2016-01-11 11:19:56
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)
★
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chemidraw 处理一下就可以了，Minimum energy
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2楼2016-01-13 17:04:34
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windf1ower

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看你用什么做对接了，sybyl的话，我一般用sybyl直接画，chemdraw画的导入进去之后还要改原子类型。画完之后先跑一个minimize，再跑一个动力学，再取动力学平均结果跑一个minimize，导出。
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问题咨询请邮件联系zhouqing_gzu@sina.com
3楼2016-01-13 22:49:54
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阿狸1205

捐助贵宾 (小有名气)
那用服务器高斯的结果和chembio的结果差别大吗，哪个更好一点

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4楼2016-01-14 09:02:58
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