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张开翅膀的鱼

铁杆木虫 (职业作家)

[求助] 如何优化大的有机分子,400个原子 已有3人参与

我想优化一个大的有机分子,原子数有四百个左右,都是CHONS,没有金属,我只是想得到优化的构型,请问该用哪种方法呢?谢谢赐教!
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jimsmart

捐助贵宾 (职业作家)

【答案】应助回帖

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引用回帖:
3楼: Originally posted by 张开翅膀的鱼 at 2015-12-23 21:12:56
谢谢!我有较大的集群计算机,之前我用过PM3 3-21g进行过优化,速度还可以吧,我所要优化分子有点大,算是个树枝分子,我想知道优化出来的结果是不是有一定的意义呢...

我觉得看您优化的目的吧.
光是优化结构,它的意义有多大呢?
既然有了集群, 而且试算也成功了, 接下来改一下设置再试就可以了啊.
因为您的分子比较大,因此参数稍变就可能通不过计算, 所以就一次改一个参数.
4楼2015-12-24 09:52:50
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