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xiaoping1986银虫 (著名写手)
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[求助]
小鼠粪便基因组提取问题 已有1人参与
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我用天根的粪便提取试剂盒提取小鼠粪便的基因组DNA，提取后测定了OD260/OD280比值为2.1，电泳结果如下图（第二泳道为提取的基因组DNA）。查阅网上资料后，说如果比值大于2，说明有RNA污染。第一次做，请有经验的人帮忙看看电泳图，是不是有RNA污染。如果有的话，应该怎么解决，后续如果做定量PCR，是否可以，对结果是否有影响？ 20151216_161101.jpg |
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 生物实验技术与方法 |
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The resulting DNA is highly contaminated with high level of secondary mateials, such as high levels of polysaccharides, polyphenols and other unknown sticky compounds that bind or co-precipitate with DNA and form a viscous complex. It is not possible to laod such DNA samples into the electrophoresis well. You could try the 3% CTAB DNA extracion protocol, modified from Zeng et al. 2002, ACta Botanica Sinica 44; 694-697. 1. washing out polysaccharides with CTAB-free buffer from homogenate. 2. increasing the percentage of CTAB in extraction medium. 3. using high concentration salts pior to DNA precipitation with isopanol.  3% CTAB DNA Extraction Protocol.jpg |
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2016-01-05 22:59:38, 50.16 K
4楼2016-01-05 22:59:54
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-12-18 12:36:00
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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香，分子生物期待您更多精彩。 2015-12-18 12:36:00
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有两种可能 一是你电泳跑太久 RNA跑没了 二是RNA降解成小片段了 OD能测出来 但是电泳图看不出来了。 你现在这个图看不出来 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2015-12-18 09:36:34
崔士元
金虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 2238.4
- 红花: 5
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- 在线: 347.6小时
- 虫号: 1092457
- 注册: 2010-09-07
- 性别: GG
- 专业: 蛋白质组学
3楼2015-12-23 10:53:02
