24小时热门版块排行榜    

查看: 2546  |  回复: 3

xiaoping1986

银虫 (著名写手)

[求助] 小鼠粪便基因组提取问题 已有1人参与

我用天根的粪便提取试剂盒提取小鼠粪便的基因组DNA,提取后测定了OD260/OD280比值为2.1,电泳结果如下图(第二泳道为提取的基因组DNA)。查阅网上资料后,说如果比值大于2,说明有RNA污染。第一次做,请有经验的人帮忙看看电泳图,是不是有RNA污染。如果有的话,应该怎么解决,后续如果做定量PCR,是否可以,对结果是否有影响?

小鼠粪便基因组提取问题
20151216_161101.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bhl2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-12-18 12:36:00
有两种可能 一是你电泳跑太久 RNA跑没了 二是RNA降解成小片段了 OD能测出来 但是电泳图看不出来了。 你现在这个图看不出来

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-12-18 09:36:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

崔士元

金虫 (正式写手)

推荐用OMEGA试剂盒,你这个是不是要做微生物组成分析?

发自小木虫IOS客户端
男人,就要对自己狠一点!
3楼2015-12-23 10:53:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

反应链

新虫 (正式写手)

The resulting DNA is highly contaminated with high level of secondary mateials, such as high levels of polysaccharides, polyphenols and other unknown sticky compounds that bind or co-precipitate with DNA and form a viscous complex. It is not possible to laod such DNA samples into the electrophoresis well.

You could try the 3% CTAB DNA extracion protocol, modified from Zeng et al. 2002, ACta Botanica Sinica 44; 694-697.

1. washing out polysaccharides with CTAB-free buffer from homogenate.
2. increasing the percentage of CTAB in extraction medium.
3. using high concentration salts pior to DNA precipitation with isopanol.
小鼠粪便基因组提取问题-1
3% CTAB DNA Extraction Protocol.jpg

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 3%_CTAB_DNA_Extraction_Protocol.pdf
  • 2016-01-05 22:59:38, 50.16 K
4楼2016-01-05 22:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaoping1986 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +13 不知道叫什么! 2026-03-15 15/750 2026-03-17 07:43 by laoshidan
[考研] 材料专硕326求调剂 +5 墨煜姒莘 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:30 by 木瓜膏
[考研] 085601求调剂 +3 Du.11 2026-03-16 3/150 2026-03-16 20:42 by 无际的草原
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +13 enenenhui 2026-03-13 14/700 2026-03-16 15:19 by 了了了了。。
[考研] 材料与化工求调剂 +3 为学666 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:09 by 加号+
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 化工0817调剂 +8 灿若星晨 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:44 by 星空星月
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
请填处理意见