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明-明-

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[求助] cif文件中的原子电荷分配已有2人参与

我在数据库中找到了伊利石的cif文件，导入MS后，先点击calculate bonds，每个原子的电荷为零，然后没有进行手动分配电荷，构建超胞后，根据文献，采用UFF力场，Qeq算法来对其进行优化，然后就出现报错了。
This periodic system bears a net charge (-64.000000e) and the
QEq calculation cannot be performed.
This periodic system bears a net charge (-64.000000e) and the
QEq calculation cannot be performed.
Unable to calculate energy and gradients.
Geometry optimization finished with an error condition.
查看报错后的晶体文件，每个原子的力场类型都分配了，但是charge还是为零，用compass力场就不会出现这种现象，优化后原子的电荷、力场均分配了。但查文献，一般是用UFF+Qeq来进行优化以及后续的吸附计算，请问这是什么原因？新人求助。。。是找来的cif文件构建晶体模型时都必须先手动分配原子电荷信息吗？

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1楼 2015-11-19 09:00:03

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引用回帖:

2楼: Originally posted by xie158795 at 2015-11-19 15:00:15
你好！应该先初始化既先赋予电荷，再去优化！你有没有学过雅可比迭代，也要先赋予初始值的！同是想问问你的cif文件是在哪找到的？？？

我再问一下，赋予电荷是需要我查文献，找到各个原子的电荷信息后，直接在properties里面的charge中直接改吗？还是用某一task直接赋予电荷，看文章里（关于蒙脱石的）是说引用的电荷参数。但优化时选择compass,以及forcefield assigned,正常运行，优化后电荷，力场都有了。晶体文件是在这个网站上找的http://www.crystallography.net/index.php
另外，Findit软件中也可以找到，直接生成cif文件。我装的08版