24小时热门版块排行榜    

查看: 2403  |  回复: 6

farfaraway08

铜虫 (著名写手)


[交流] 关于磷酸银电子结构计算的问题

大家好,最近在学习MS计算半导体结构,在计算磷酸银结构的时候,出现了一个问题。从小木虫导出的cif文件导入到ms中进行计算的时候,发现模型很怪异,一个坐标处有两个银原子存在。计算一进行就出错。我把计算的模型贴在下面了,还请版里的各位帮忙讲解下是由于什么原因出现这样的情况,谢谢了。

emuchAg3PO4.JPG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DFPT

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
farfaraway08(金币+1): 谢谢参与
farfaraway08: 金币+4, 非常感谢您的解答,我马上去试试手动输入的方式。 2013-05-09 08:59:30
对于四方结构,不少空间群有着几种不同的原点选择方法。而直接导入cif的话,MS会直接选择默认的原点。
对于此类情况,建议根据cif内容手动建模,并且一定对比一下空间群的原点是否选择正确。
2楼2013-05-08 16:52:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

farfaraway08

铜虫 (著名写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by DFPT at 2013-05-08 16:52:44
对于四方结构,不少空间群有着几种不同的原点选择方法。而直接导入cif的话,MS会直接选择默认的原点。
对于此类情况,建议根据cif内容手动建模,并且一定对比一下空间群的原点是否选择正确。

您好,我查到了cif的内容,但是发现在用ms构建磷酸银结构的时候出现了问题。下面的数值中Ag的sof为0.5,当按照前面的X,Y,Z输入进去的时候发现得到的是:Chosen position is within the specified tolerance (1.0) of a symmetry copy of itself.Do you wish to continue adding an atom at this position?不知为什么会出现这样的情况,还请您帮忙看看。谢谢您了。
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Ag   1  +1    12 h  0.2255(8)   0           0.5            0.5        0   
P    1  +5    2 a   0           0           0              1.         0   
O    1  -2    8 e   0.1469(3)   0.1469(3)   0.1469(3)      1.         0
3楼2013-05-09 09:18:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DFPT

金虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ben_ladeng: 屏蔽内容 2013-05-10 00:39:08
本帖内容被屏蔽

4楼2013-05-09 23:21:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DFPT

金虫 (小有名气)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
之前回复有误,没看到Ag的z方向还有个0.5。
当Ag的坐标是如cif中一样时,会有LZ的情况发生,这是因为,根据F-43n的对称性,会有Ag坐标在(0.2255, 0, 0.5)和(0.2745, 0, 0.5),而这两个原子的位置非常近。得到的结构图为:

同时可以看到,Ag在12h的占据态是0.5,也就是说,无论是(0.2255, 0, 1/2)还是(0.2745, 0, 0.5),Ag离子只能占据一个。考虑到这两个都非常近,所以可以简化Ag的占据为(0.25, 0, 1/2)。此时结构图为:

同样的计算方法,曾经发布在文章J. Phys. Chem. C, 115 (2011), 4680-4687中。文章作者也是使用CASTEP进行计算的。
5楼2013-05-09 23:42:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

farfaraway08

铜虫 (著名写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by DFPT at 2013-05-09 23:42:38
之前回复有误,没看到Ag的z方向还有个0.5。
当Ag的坐标是如cif中一样时,会有LZ的情况发生,这是因为,根据F-43n的对称性,会有Ag坐标在(0.2255, 0, 0.5)和(0.2745, 0, 0.5),而这两个原子的位置非常近。得到的结构 ...

非常感谢,真心的谢谢您的详细解答。太感谢您了,以后还请您多多帮忙指教。
6楼2013-05-10 18:02:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yy82610155

铜虫 (初入文坛)


★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用findit导出结构啊。
7楼2014-04-02 15:45:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 farfaraway08 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 3/150 2026-11-10 01:40 by FChKX8meu1ds
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见