24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2557  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

背包旅客

新虫 (初入文坛)

[求助] 跪求Amber软件的MM-PBSA怎么进行能量分解?

本人使用Gromacs4.5.5版本进行的MD,然后用Amber软件的MM-PBSA计算小分子-蛋白复合物的结合自由能。但是现在我导师要求我计算一下残基的能量分解!可是我不会啊!,也不懂去哪找教程。。。看到虫友有说这个的,可是看不清楚。。。跪求各位大神帮忙!!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

背包旅客

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by hdx1991 at 2015-11-09 16:43:32
进amber官网点击tuitor然后往下翻找他计算结合能的教程,教程的最后一步讲如何计算结和能用amber

你好,请问你做过Amber官网的MM-PBSA的教程吗??、我现在直接卡在第一部分啦!运行不下去。。。可以请教一下你么???
6楼2015-11-13 17:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

hdx1991

新虫 (著名写手)

2楼2015-11-09 12:22:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

背包旅客

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hdx1991 at 2015-11-09 12:22:48
amber官网有教程

可以具体一点么???是Amber官网的MM-PBSA的教程吗?
3楼2015-11-09 15:02:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hdx1991

新虫 (著名写手)

进amber官网点击tuitor然后往下翻找他计算结合能的教程,教程的最后一步讲如何计算结和能用amber

发自小木虫Android客户端
4楼2015-11-09 16:43:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 083000学硕274求调剂 +10 Li李鱼 2026-03-26 10/500 2026-03-31 03:31 by 蒙奇奇521
[考研] 085602化工求调剂(331分) +8 111@127 2026-03-30 8/400 2026-03-30 21:23 by 研究僧导导
[考研] 一志愿中海洋材料357 +3 麦恩莉. 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:01 by chixmc
[考研] 085600,专业课化工原理,320分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-29 5/250 2026-03-30 19:02 by 源_2020
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +18 Mr. Z 2026-03-25 19/950 2026-03-30 19:01 by Wang200018
[考研] 262求调剂 +4 ZZ..000 2026-03-30 4/200 2026-03-30 15:57 by wangjy2002
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +4 邱gl 2026-03-26 7/350 2026-03-30 08:39 by 探123
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-29 20:21 by dophin1985
[考研] 343求调剂 +6 爱羁绊 2026-03-29 6/300 2026-03-29 12:00 by 无际的草原
[考研] 311(085601)求调剂 +4 liziyeyeye 2026-03-28 4/200 2026-03-28 18:50 by 535743368
[考研] 283求调剂 +3 A child 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:41 by ms629
[考研] 0856,材料与化工321分求调剂 +12 大馋小子 2026-03-27 13/650 2026-03-28 10:56 by self2008
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-27 7/350 2026-03-28 07:43 by 热情沙漠
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 8/400 2026-03-27 16:38 by 18419759900
[考研] 085600,材料与化工321分,求调剂 +9 大馋小子 2026-03-27 9/450 2026-03-27 14:30 by mmm just
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 5/250 2026-03-27 10:33 by wangjy2002
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
信息提示
请填处理意见