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[求助]
Amber处理蛋白问题，求解答
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我刚刚学习AMBER软件 处理蛋白check com 时候 出现如下警告： > check com Checking 'com'.... WARNING: The unperturbed charge of the unit: -17.000000 is not zero. Warning: Close contact of 2.227786 angstroms between .R<GLU 176>.A<HA 4> and .R<TYR 459>.A<HH 15> Warning: Close contact of 2.202240 angstroms between .R<SER 398>.A<HG 9> and .R<ILE 530>.A<H 2> Checking parameters for unit 'com'. Checking for bond parameters. Checking for angle parameters. check: Warnings: 3 Unit is OK. 这是什么意思？怎么处理这个问题呢？ 之后我最小化可以正常进行 但是在升温时遇到rst文件生成不出来，是不是以上问题导致的呢？卡在这好几天了 很郁闷 希望有大神不吝解答 跪谢 [ Last edited by gss0840401 on 2013-7-22 at 14:34 ] |
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