应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 求助crispr-cas9引物设计软件
111/2返回列表12下一页
查看: 3566  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zb0806030

银虫 (小有名气)

[求助] 求助crispr-cas9引物设计软件 已有4人参与

上海植生所薛红卫老师15年在JIPB上发表了一篇CRISPR Primer Designer: Design primers forknockout and chromosome imaging CRISPR-Cassystem文章，求助哪位虫友有这个CRISPR Primer Designer的软件，非常感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

crispr-cas9 相关资料

» 猜你喜欢
厚积薄发
1楼 2015-11-04 08:45:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Hare_ma

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zb0806030: 金币+2, ★有帮助 2015-11-04 14:36:11
我知道有两个在线设计引物的软件，不知道是不是你要的
http://crispr.mit.edu/
http://www.e-crisp.org/E-CRISP/designcrispr.html

就算不是，我觉得你说的那个肯定也是在线设计引物的，不防把关键词在Google里搜一下，希望有帮助到你
赞一下 回复此楼
星星真美，因为有一朵看不见的花。。。
2楼2015-11-04 11:12:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zb0806030

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Hare_ma at 2015-11-04 11:12:45
我知道有两个在线设计引物的软件，不知道是不是你要的
http://crispr.mit.edu/
http://www.e-crisp.org/E-CRISP/designcrispr.html

就算不是，我觉得你说的那个肯定也是在线设计引物的，不防把关键词在Google里 ...

谢谢你的回复，我也知道有在线设计的软件，但选起来相对复杂，我看文献里他那个挺简单方便的，所以想问问有没有人有，应该不是在线的软件
赞一下 回复此楼
厚积薄发
3楼2015-11-04 14:36:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Hare_ma

专家顾问 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zb0806030 at 2015-11-04 14:36:02
谢谢你的回复，我也知道有在线设计的软件，但选起来相对复杂，我看文献里他那个挺简单方便的，所以想问问有没有人有，应该不是在线的软件...

那就不知道了

发自小木虫Android客户端
回复此楼
星星真美，因为有一朵看不见的花。。。
4楼2015-11-04 15:48:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lylyly2006

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我最近也有在设计，我先看看能不能用，我是可以同时敲掉两个基因的载体

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2015-11-07 14:44:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zb0806030

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lylyly2006 at 2015-11-07 14:44:00
我最近也有在设计，我先看看能不能用，我是可以同时敲掉两个基因的载体

谢谢啦，我也想同时敲掉两个或者三个基因，这三个基因碱基相似度很高
赞一下 回复此楼
厚积薄发
6楼2015-11-09 16:57:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloudy8797

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lylyly2006 at 2015-11-07 14:44:00
我最近也有在设计，我先看看能不能用，我是可以同时敲掉两个基因的载体

想问一下，设计鉴定crispr-cas9敲除的引物有什么原则之类的吗，我都射击类好几对引物，总是扩不出目标带，求指教啊
赞一下 回复此楼
7楼2015-11-13 16:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1lovingfly

新虫 (小有名气)
你好，请教一下，CRISPR结果是否基因敲除，可以直接pcr测序吗

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2015-11-17 20:40:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by zb0806030 at 2015-11-09 16:57:51
谢谢啦，我也想同时敲掉两个或者三个基因，这三个基因碱基相似度很高...

既然这样，比对下保守的序列，只要设计一个sgRNA就有可能同时敲除三个基因。本人已经实验验证，并且刚刚被JIPB杂志录用。
赞一下 回复此楼
9楼2017-12-09 10:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 1lovingfly at 2015-11-17 20:40:50
你好，请教一下，CRISPR结果是否基因敲除，可以直接pcr测序吗

如果是植物通过愈伤组织转基因，则转基因植株可以通过PCR测序。
如果是拟南芥通过花浸润法转基因，则PCR测序可能无法看到突变的峰形，因为是嵌合体（假设是植物的用35S启动子）。
而如果拟南芥花浸润法选择遗传所的谢旗老师组的YAO启动子，则可以通过PCR测序检测T1代植株。即跟愈伤组织转基因一样。
赞一下 回复此楼
10楼2017-12-09 10:29:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zb0806030 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 11:41 by KxMI1BYBxWX1
[基金申请] filecode +7 cratir 2026-08-14 11/550 2026-08-15 06:19 by 学员8dgXkO
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 7/350 2026-08-15 00:40 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭