24小时热门版块排行榜    

查看: 3362  |  回复: 10

zb0806030

银虫 (小有名气)

[求助] 求助crispr-cas9引物设计软件 已有4人参与

上海植生所薛红卫老师15年在JIPB上发表了一篇CRISPR Primer Designer: Design primers forknockout and chromosome imaging CRISPR-Cassystem文章,求助哪位虫友有这个CRISPR Primer Designer的软件,非常感谢!
回复此楼
厚积薄发
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Hare_ma

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zb0806030: 金币+2, 有帮助 2015-11-04 14:36:11
我知道有两个在线设计引物的软件,不知道是不是你要的
http://crispr.mit.edu/
http://www.e-crisp.org/E-CRISP/designcrispr.html

就算不是,我觉得你说的那个肯定也是在线设计引物的,不防把关键词在Google里搜一下,希望有帮助到你
星星真美,因为有一朵看不见的花。。。
2楼2015-11-04 11:12:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zb0806030

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Hare_ma at 2015-11-04 11:12:45
我知道有两个在线设计引物的软件,不知道是不是你要的
http://crispr.mit.edu/
http://www.e-crisp.org/E-CRISP/designcrispr.html

就算不是,我觉得你说的那个肯定也是在线设计引物的,不防把关键词在Google里 ...

谢谢你的回复,我也知道有在线设计的软件,但选起来相对复杂,我看文献里他那个挺简单方便的,所以想问问有没有人有,应该不是在线的软件
厚积薄发
3楼2015-11-04 14:36:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Hare_ma

专家顾问 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zb0806030 at 2015-11-04 14:36:02
谢谢你的回复,我也知道有在线设计的软件,但选起来相对复杂,我看文献里他那个挺简单方便的,所以想问问有没有人有,应该不是在线的软件...

那就不知道了

发自小木虫Android客户端
星星真美,因为有一朵看不见的花。。。
4楼2015-11-04 15:48:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lylyly2006

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我最近也有在设计,我先看看能不能用,我是可以同时敲掉两个基因的载体

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-11-07 14:44:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zb0806030

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lylyly2006 at 2015-11-07 14:44:00
我最近也有在设计,我先看看能不能用,我是可以同时敲掉两个基因的载体

谢谢啦,我也想同时敲掉两个或者三个基因,这三个基因碱基相似度很高
厚积薄发
6楼2015-11-09 16:57:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloudy8797

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lylyly2006 at 2015-11-07 14:44:00
我最近也有在设计,我先看看能不能用,我是可以同时敲掉两个基因的载体

想问一下,设计鉴定crispr-cas9敲除的引物有什么原则之类的吗,我都射击类好几对引物,总是扩不出目标带,求指教啊
7楼2015-11-13 16:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1lovingfly

新虫 (小有名气)

你好,请教一下,CRISPR结果是否基因敲除,可以直接pcr测序吗

发自小木虫Android客户端
8楼2015-11-17 20:40:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by zb0806030 at 2015-11-09 16:57:51
谢谢啦,我也想同时敲掉两个或者三个基因,这三个基因碱基相似度很高...

既然这样,比对下保守的序列,只要设计一个sgRNA就有可能同时敲除三个基因。本人已经实验验证,并且刚刚被JIPB杂志录用。
9楼2017-12-09 10:26:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 1lovingfly at 2015-11-17 20:40:50
你好,请教一下,CRISPR结果是否基因敲除,可以直接pcr测序吗

如果是植物通过愈伤组织转基因,则转基因植株可以通过PCR测序。
如果是拟南芥通过花浸润法转基因,则PCR测序可能无法看到突变的峰形,因为是嵌合体(假设是植物的用35S启动子)。
而如果拟南芥花浸润法选择遗传所的谢旗老师组的YAO启动子,则可以通过PCR测序检测T1代植株。即跟愈伤组织转基因一样。
10楼2017-12-09 10:29:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zb0806030 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-09 4/200 2026-03-16 01:21 by Xttdmn
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +6 一鸭鸭哟 2026-03-14 7/350 2026-03-15 22:12 by Winj1e
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +3 Liwangman 2026-03-15 3/150 2026-03-15 18:16 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 鹤遨予卿 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:44 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,药学 +3 归零lbm 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:21 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-09 4/200 2026-03-14 02:06 by tranquil_ya
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +4 ly3471z 2026-03-13 4/200 2026-03-13 13:00 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 材料调剂,307分 +13 张泳铭1 2026-03-09 17/850 2026-03-13 11:09 by 薛云鹏
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 一志愿山东大学,总分327,英语二79,有论文,有竞赛,已过四六级 +3 木木目目1 2026-03-09 3/150 2026-03-09 19:52 by yuningshan
信息提示
请填处理意见