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引物设计中的信号肽问题,是从信号肽开始还是从CDS的第一个碱基开始? 已有1人参与
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设计引物时应该从第一个碱基开始还是从信号肽开始,还是从CDS的第一个碱基开始? 如一个序列 CDS 序列是 57~560, sig_peptide 从 57~119, mat_peptide 从 120~557。应该从第几个开始设计?从第121个开始? |
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【答案】应助回帖
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看你的需求了,如果你需要表达的蛋白在细胞内自己加工成熟,就从57号位开始设计,如果你只是需要表达成熟后的蛋白,就从120位开始设计!但是很多蛋白都是要定位到特定区域,经过剪切成熟后才发挥功能,所以有时候信号肽很重要,你而不是表达出成熟的蛋白就可以发挥功能这么简单。当然,还是需要通过文献和你自己的实验目的来确定! 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-10-29 10:59:08
【答案】应助回帖
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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-10-30 21:21:56
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当然,无论怎样,别忘了起始和终止密码子,所在哺乳动物细胞内做表达,需要在5'端加入Kozak序列: GCCACCATGG. ATG为起始密码子! 发自小木虫Android客户端 |
3楼2015-10-29 11:03:50
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4楼2015-10-30 09:54:05
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