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引物设计中的信号肽问题，是从信号肽开始还是从CDS的第一个碱基开始？ 已有1人参与
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设计引物时应该从第一个碱基开始还是从信号肽开始，还是从CDS的第一个碱基开始？ 如一个序列 CDS 序列是 57～560， sig_peptide 从 57～119， mat_peptide 从 120～557。应该从第几个开始设计？从第121个开始？ |
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Stridegogogo
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4楼2015-10-30 09:54:05
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看你的需求了，如果你需要表达的蛋白在细胞内自己加工成熟，就从57号位开始设计，如果你只是需要表达成熟后的蛋白，就从120位开始设计！但是很多蛋白都是要定位到特定区域，经过剪切成熟后才发挥功能，所以有时候信号肽很重要，你而不是表达出成熟的蛋白就可以发挥功能这么简单。当然，还是需要通过文献和你自己的实验目的来确定！ 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-10-29 10:59:08
sonny
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当然，无论怎样，别忘了起始和终止密码子，所在哺乳动物细胞内做表达，需要在5＇端加入Kozak序列: GCCACCATGG. ATG为起始密码子！ 发自小木虫Android客户端 |
3楼2015-10-29 11:03:50
Stridegogogo
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5楼2015-10-30 10:13:59